【发布时间】:2020-11-26 03:41:44
【问题描述】:
假设numpy 数组X 的形状为m x n 并输入float64。 X 的行需要通过按元素计算的均值中值。具体来说,m 行索引被划分为b“桶”,每个都包含m/b 这样的索引。接下来,我在每个桶中计算均值,并在所得均值上进行最终中值计算。
一个说明它的例子是
import numpy as np
m = 10
n = 10000
# A random data matrix
X = np.random.uniform(low=0.0, high=1.0, size=(m,n)).astype(np.float64)
# Number of buckets to split rows into
b = 5
# Partition the rows of X into b buckets
row_indices = np.arange(X.shape[0])
buckets = np.array(np.array_split(row_indices, b))
X_bucketed = X[buckets, :]
# Compute the mean within each bucket
bucket_means = np.mean(X_bucketed, axis=1)
# Compute the median-of-means
median = np.median(bucket_means, axis=0)
# Edit - Method 2 (based on answer)
np.random.shuffle(row_indices)
X = X[row_indices, :]
buckets2 = np.array_split(X, b, axis=0)
bucket_means2 = [np.mean(x, axis=0) for x in buckets2]
median2 = np.median(np.array(bucket_means2), axis=0)
如果b 将m 相除,则此程序运行良好,因为np.array_split() 导致将索引分成相等的部分并且数组buckets 是一个二维数组。
但是,如果b 不分割m,则它不起作用。在这种情况下,np.array_split() 仍会拆分为 b 存储桶,但大小不同,这对我的目的来说很好。例如,如果 b = 3 它将索引 {0,1,...,9} 拆分为 [0 1 2 3]、[4 5 6] 和 [7 8 9]。这些数组不能相互堆叠,因此数组buckets 不是二维数组,它不能用于索引X_bucketed。
我怎样才能使这适用于大小不等的桶,即让程序计算每个桶内的平均值(无论其大小),然后计算桶的中位数?
我无法完全掌握masked arrays,我不确定是否可以在这里使用。
【问题讨论】:
标签: python numpy median-of-medians