如何在 R 中为我的热图添加图例？

【问题标题】：How do I add a legend to my heatmap in R?如何在 R 中为我的热图添加图例？
【发布时间】：2021-07-27 22:00:27
【问题描述】：

我有一个基因表达的大型数据集。行是基因。列是特定组织-因此是该组织中的基因表达

我正在使用以下代码制作热图：

heatmap(expression_all_tissues_matrix, scale= "column",col=brewer.pal(9,"Blues"))

我不知道如何制作传奇。我尝试单独制作图例/键，但我无法弄清楚如何在 brewer.pal 中使用“Blues”。

谢谢！

【问题讨论】：

【解决方案1】：

pheatmap 包及其同名功能的使用可以让您获得所需的内容。下面的代码可以让你在同一张图上有图例。

require(pheatmap)
require(RColorBrewer)
pheatmap(as.matrix(expression_all_tissues_matrix),color=brewer.pal(9,"Blues"))

您还可以使用多个参数来通过集群关联行和列，但如果您不想对它们进行分类，只需使用参数 cluster_rows = F 和 cluster_col = F 。不要忘记标准化数据，它可以帮助您获得更好的渲染。使用?pheatmap了解更多信息。

【讨论】：