在 matplotlib 中添加 graphviz 图答案

【问题标题】：Add graphviz plot inside matplotlib在 matplotlib 中添加 graphviz 图
【发布时间】：2021-02-16 05:42:23
【问题描述】：

我正在使用networkx 可视化各种网络。看一个简单的例子

    graph = nx.DiGraph()
    graph.add_edge("a", "b")
    graph.add_edge("a", "a")
    nx.draw(graph)
    plt.show()

不幸的是，networkx 绘图不会呈现自循环。我知道其他功能丰富的软件包，例如 GraphViz 及其实现 pygraphviz。但是，这些包不允许我自定义我的图（如子图、注释等）。我可以使用networkx 完成所有这些操作，因为它可以使用matplotlib Axes 进行绘图。这对于编程操作和大量自定义非常方便。有没有办法让GraphViz 到matplotlib 的网络绘图？

我总是可以使用imshow 将GraphViz 创建的PNG 嵌入到matplotlib 绘图中。然而，它的结果很糟糕，几乎没有自定义控制。

【问题讨论】：

标签： python matplotlib networkx graphviz

【解决方案1】：

我不确定你为什么说 networkx 不呈现自循环。这不是你要找的吗？

import networkx as nx
from matplotlib import pyplot as plt

graph = nx.DiGraph()
graph.add_edges_from([("a", "b"), ("a", "a"), ("b", "b"), ("c", "b"), ("c", "c")])
nx.draw(graph, with_labels=True)
plt.show()

【讨论】：

【解决方案2】：

这似乎还不存在。如果你想自己实现它，有几个选项。如果您想将布局留给 Graphviz，而只将形状和位置交给 Matplotlib，则剩下两个选项来获取渲染所需的数据：

您将二进制文件（如 dot）与 -Tjson option 一起使用，这似乎会发出所有必要的绘图数据，但我没有找到文档，例如ops 是。
你Use Graphviz as a Library。第 2.3 节（渲染图表）介绍了如何访问数据。

然后您将这些数据输入到Axes'Artist (tutorial)。 Matplotlib 还有一个tutorial for how to draw paths。

【讨论】：