在 H5PY 中打开文件时出错（未找到文件签名）答案

【问题标题】：Error opening file in H5PY (File signature not found)在 H5PY 中打开文件时出错（未找到文件签名）
【发布时间】：2016-10-31 14:12:33
【问题描述】：

我一直在使用以下代码打开一些在 MATLAB 中使用 H5PY 在 python 中生成的 HDF5 文件：

import h5py as h5
data='dataset.mat'
f=h5.File(data, 'r')

但是我收到以下错误：

OSError: Unable to open file (File signature not found)

我已检查我尝试打开的文件是 7.3 版 MAT 文件并且是 HDF5 格式。事实上，我之前已经使用 H5PY 成功打开过相同的文件。我已经确认这些文件存在并且可以访问，所以我不确定错误来自哪里。任何建议将不胜感激，在此先感谢:)

【问题讨论】：

【解决方案1】：

通常消息File signature not found 表示：

1.您的文件已损坏。

...是我认为最有可能的。你说你以前打开过文件。也许您忘记关闭可能损坏文件的文件句柄。尝试使用 HDF5 实用程序 h5debug 检查文件（如果您在操作系统上安装了 hdf5 库，则可以在命令行上使用，在 Linux 上使用 dpkg -s libhdf5-dev 检查）。

2。该文件不是 HDF5 格式。

这是您的错误消息的已知原因。但是，既然你说你确定，情况就是这样，而且你之前已经打开过文件，我给出这个仅供参考，以供可能在这里遇到问题的其他人参考：

自 2015 年 12 月（自 7.3 版起），Matlab 文件在其MAT-File Level 5 Containers（更多doc）中使用基于 HDF5 的格式。 scipy 库支持早期版本的 MAT 文件（v4（1.0 级）、v6 和 v7 到 7.2）并可以使用它读取：

import scipy.io
f = scipy.io.loadmat('dataset.mat')

否则你可以尝试其他方法，看看错误是否仍然存在：

PyTables 是 h5py 的替代品，可以在 here 找到。

import tables
file = tables.open_file('test.mat')

使用安装

pip install tables

如果您安装了 matlab，

Python MATLAB 引擎 是读取 MAT 文件的替代方法。可在此处找到文档：MATLAB Engine API for Python。

import matlab.engine
mat = matlab.engine.start_matlab()
f = mat.load("dataset.mat", nargout=1)

【讨论】：

【解决方案2】：

我的 .h5 文件也遇到了同样的问题。问题是我没有正确下载 .h5 文件。

我正在执行 filename.h5->right_click->将链接另存为，没有正确下载文件（或者文件可能已损坏）。我没有这样做，而是将文件下载为：选中带有 filename.h5 的复选框并单击下载，然后我的代码就可以工作了。

这可能对犯同样错误的人有所帮助。

【讨论】：

【解决方案3】：

这通常发生在文件损坏时。我遇到了这个问题并再次下载了文件并解决了问题。

【讨论】：

【解决方案4】：

如果有人在 Jupyter 中遇到此问题，您只需单击文件的复选框，然后单击下载按钮。
我从here 得到的这个解决方案对我有帮助，希望对你们有帮助。

【讨论】：

【解决方案5】：

用tar -czvf zipfilename.tar.gz weightsfile 压缩文件对我有用。

【讨论】：