【问题标题】:How to get studentized residuals from pgls() in Caper R package如何从 Caper R 包中的 pgls() 获取学生化残差
【发布时间】:2015-04-07 07:11:18
【问题描述】:

我有一个包含 135 个物种、6 个生活史特征(响应)和 2 个环境变量(预测变量)的数据集。我有兴趣使用 Caper 包进行 pgls 回归分析,以查看环境变量对每个生活史特征的影响。由于其中一个特征是女性体重,我计算了每个性状对女性体重的 pgls 回归,并在针对环境变量的多元回归中使用了随后的残差。为了检查回归诊断在针对体重的单变量特征回归中是否正常,我使用了 plot.pgls()。这些图显示了一些异常值的存在。在 Caper 中使用 pgls 的一些论文中,学生化残差 >3 的数据点已被排除为异常值。

  1. 谁能帮我弄清楚如何从 Caper 中的 pgls 回归计算学生化残差?
  2. pgls 回归给出系统发育和非系统发育残差。其中哪一个是学生化残差计算的?

感谢您的时间和帮助, pb

【问题讨论】:

  • 你能举出一个可重现的小例子吗?

标签: r regression phylogeny


【解决方案1】:

我最近在这个网站上看到了一个详细的示例,说明如何从 Caper 中的 pgls() 计算标准化残差并诊断异常值。 http://www.anthrotree.info/wiki/pages/w5j9m8/7.5.html

PBA

【讨论】:

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