如何在 Apple Silicon (ARM / M1) 上安装 SciPy

Question

我已经成功地在带有 Apple Silicon 的新 Mac mini 上安装了带有 Numpy 和 Matplotlib 的 python 3.9.1。但是，我无法安装 SciPy：使用时出现编译错误

python3 -m pip install scipy

我还尝试从 brew 安装所有内容，并且“import scipy”可以正常工作，但是使用它会出现 seg 错误。我已经安装了 ARM 版本的 lapack 和 openblas，但这并不能解决问题。

有人成功了吗？ （我有兴趣在本地运行它，而不是通过 Rosetta）。

Answer 1

另外，如果有人有这个错误信息>

########### CLIB COMPILER OPTIMIZATION ###########
Platform      :
  Architecture: aarch64
  Compiler    : clang

CPU baseline  :
  Requested   : 'min'
  Enabled     : none
  Flags       : none
  Extra checks: none

CPU dispatch  :
  Requested   : 'max -xop -fma4'
  Enabled     : none
  Generated   : none
CCompilerOpt.cache_flush[809] : write cache to path 

我在编译 numpy 和 scipy 之前找到了这个解决方案

原因分析： 从上面的报错信息可以看出最后一个报错说明clang有错误，所以推测应该是编译器导致的错误，因为新版本的xcode命令工具使用的是arm版本的默认编译方式，如果要使用x86架构，需要通过环境变量手动设置具体架构。

export ARCHFLAGS="-arch x86_64"

示例：

3c790c45799ec8c598753ebb22/build/temp.macosx-10.14.6-arm64-3.8/ccompiler_opt_cache_clib.py
    ----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: /Users/daniel_edu/Projects/PERSONAL/great_expectation_demo/.env/bin/python3 -u -c 'import io, os, sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/private/var/folders/zb/c_b9kh2x1px7vl5683rwz8fr0000gn/T/pip-install-y8alaej_/numpy_3d813a3c790c45799ec8c598753ebb22/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/private/var/folders/zb/c_b9kh2x1px7vl5683rwz8fr0000gn/T/pip-install-y8alaej_/numpy_3d813a3c790c45799ec8c598753ebb22/setup.py'"'"';f = getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__) if os.path.exists(__file__) else io.StringIO('"'"'from setuptools import setup; setup()'"'"');code = f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' install --record /private/var/folders/zb/c_b9kh2x1px7vl5683rwz8fr0000gn/T/pip-record-q9vraevr/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /Users/daniel_edu/Projects/PERSONAL/great_expectation_demo/.env/include/site/python3.8/numpy Check the logs for full command output.
(.env) ➜  great_expectation_demo git:(master) ✗ export ARCHFLAGS="-arch x86_64"
(.env) ➜  great_expectation_demo git:(master) ✗ pip install --no-binary :all: --no-use-pep517 numpy
Collecting numpy
  Using cached numpy-1.21.5.zip (10.7 MB)
  Preparing metadata (setup.py) ... done
Skipping wheel build for numpy, due to binaries being disabled for it.
Installing collected packages: numpy
    Running setup.py install for numpy ... done
Successfully installed numpy-1.21.5

Answer 2

可以在普通的arm64 brew python上安装，需要自己编译。

如果numpy 已安装（从轮子），您需要将其卸载：

pip3 uninstall -y numpy pythran

我必须编译numpy，这需要cython和pybind11：

pip3 install cython pybind11

那么numpy就可以编译了：

pip3 install --no-binary :all: --no-use-pep517 numpy

Scipy 需要 pythran（这应该在安装 numpy 后发生）：

pip3 install pythran

然后我们需要自己编译scipy，它依赖于fortran和BLAS/LACK：

brew install openblas gfortran

告诉scipy在哪里可以找到这个库：

export OPENBLAS=/opt/homebrew/opt/openblas/lib/

然后最后编译scipy:

pip3 install --no-binary :all: --no-use-pep517 scipy

Answer 3

这个在浪费时间后为我工作了：

pip install --pre -i https://pypi.anaconda.org/scipy-wheels-nightly/simple scipy

Answer 4

对于那些短期需要它并且不想太忙的人 - 它似乎可以与 python 3.6.4 和 scipy 1.5.4 一起使用（Big Sur 11.5.2，M1 芯片） .

Answer 5

我设法在 Apple Silicon 上安装了 scipy。我在这里主要遵循 lutzroeder 的指示：https://github.com/scipy/scipy/issues/13409

这些说明对我来说并不成功，但之后运行“pip3 install scipy”就可以了。我认为这解决了我的问题：

/opt/homebrew/bin/brew install openblas

export OPENBLAS=$(/opt/homebrew/bin/brew --prefix openblas)

export CFLAGS="-falign-functions=8 ${CFLAGS}"

Answer 6

This solution 使用 pyenv 在我的 M1 机器上工作：

brew install openblas
OPENBLAS="$(brew --prefix openblas)" pip install numpy scipy

Answer 7

对我来说最简单的解决方案：

brew install scipy

编辑 PATH 可能是个好主意，因此自制版本将是默认版本。

Answer 8

您可以从https://github.com/conda-forge/miniforge#miniforge3 安装 miniforge 然后安装这些软件包，

conda install numpy scipy matplotlib