共享只读数据是否复制到不同的进程以进行多处理？

Question

我的这段代码看起来像这样：

glbl_array = # a 3 Gb array

def my_func( args, def_param = glbl_array):
    #do stuff on args and def_param

if __name__ == '__main__':
  pool = Pool(processes=4)
  pool.map(my_func, range(1000))

有没有办法确保（或鼓励）不同的进程不会获得 glbl_array 的副本而是共享它。如果无法停止复制，我将使用 memmapped 数组，但我的访问模式不是很规律，所以我希望 memmapped 数组更慢。以上似乎是首先要尝试的。这是在 Linux 上。我只是想从 Stackoverflow 获得一些建议，不想惹恼系统管理员。如果第二个参数是真正的不可变对象，如glbl_array.tostring()，您认为会有帮助吗？

Answer 1

如果您正在寻找一种在 Windows 上高效工作的选项，并且适用于不规则访问模式、分支和其他可能需要基于共享内存矩阵和进程的组合分析不同矩阵的场景 -本地数据，ParallelRegression 包中的 mathDict 工具包旨在处理这种确切情况。

Answer 2

以下代码适用于 Win7 和 Mac（可能适用于 linux，但未经测试）。

import multiprocessing
import ctypes
import numpy as np

#-- edited 2015-05-01: the assert check below checks the wrong thing
#   with recent versions of Numpy/multiprocessing. That no copy is made
#   is indicated by the fact that the program prints the output shown below.
## No copy was made
##assert shared_array.base.base is shared_array_base.get_obj()

shared_array = None

def init(shared_array_base):
    global shared_array
    shared_array = np.ctypeslib.as_array(shared_array_base.get_obj())
    shared_array = shared_array.reshape(10, 10)

# Parallel processing
def my_func(i):
    shared_array[i, :] = i

if __name__ == '__main__':
    shared_array_base = multiprocessing.Array(ctypes.c_double, 10*10)

    pool = multiprocessing.Pool(processes=4, initializer=init, initargs=(shared_array_base,))
    pool.map(my_func, range(10))

    shared_array = np.ctypeslib.as_array(shared_array_base.get_obj())
    shared_array = shared_array.reshape(10, 10)
    print shared_array

Answer 3

您可以相当轻松地将来自multiprocessing 的共享内存内容与 Numpy 一起使用：

import multiprocessing
import ctypes
import numpy as np

shared_array_base = multiprocessing.Array(ctypes.c_double, 10*10)
shared_array = np.ctypeslib.as_array(shared_array_base.get_obj())
shared_array = shared_array.reshape(10, 10)

#-- edited 2015-05-01: the assert check below checks the wrong thing
#   with recent versions of Numpy/multiprocessing. That no copy is made
#   is indicated by the fact that the program prints the output shown below.
## No copy was made
##assert shared_array.base.base is shared_array_base.get_obj()

# Parallel processing
def my_func(i, def_param=shared_array):
    shared_array[i,:] = i

if __name__ == '__main__':
    pool = multiprocessing.Pool(processes=4)
    pool.map(my_func, range(10))

    print shared_array

打印

[[ 0.  0.  0.  0.  0.  0.  0.  0.  0.  0.]
 [ 1.  1.  1.  1.  1.  1.  1.  1.  1.  1.]
 [ 2.  2.  2.  2.  2.  2.  2.  2.  2.  2.]
 [ 3.  3.  3.  3.  3.  3.  3.  3.  3.  3.]
 [ 4.  4.  4.  4.  4.  4.  4.  4.  4.  4.]
 [ 5.  5.  5.  5.  5.  5.  5.  5.  5.  5.]
 [ 6.  6.  6.  6.  6.  6.  6.  6.  6.  6.]
 [ 7.  7.  7.  7.  7.  7.  7.  7.  7.  7.]
 [ 8.  8.  8.  8.  8.  8.  8.  8.  8.  8.]
 [ 9.  9.  9.  9.  9.  9.  9.  9.  9.  9.]]

不过，Linux 在fork() 上具有写时复制语义，因此即使不使用multiprocessing.Array，除非写入数据，否则数据不会被复制。

Answer 4

对于那些坚持使用不支持fork()（除非使用 CygWin）的 Windows 的人，pv 的答案不起作用。全局变量不可用于子进程。

相反，您必须在 Pool/Process 的初始化过程中传递共享内存，如下所示：

#! /usr/bin/python

import time

from multiprocessing import Process, Queue, Array

def f(q,a):
    m = q.get()
    print m
    print a[0], a[1], a[2]
    m = q.get()
    print m
    print a[0], a[1], a[2]

if __name__ == '__main__':
    a = Array('B', (1, 2, 3), lock=False)
    q = Queue()
    p = Process(target=f, args=(q,a))
    p.start()
    q.put([1, 2, 3])
    time.sleep(1)
    a[0:3] = (4, 5, 6)
    q.put([4, 5, 6])
    p.join()

（它不是 numpy 也不是好的代码，但它说明了这一点 ;-)