loop_apply.o：文件无法识别：文件格式无法识别答案

【问题标题】：loop_apply.o: file not recognized: File format not recognizedloop_apply.o：文件无法识别：文件格式无法识别
【发布时间】：2018-02-15 11:44:42
【问题描述】：

我正在尝试安装 R 的 plyr 软件包。这是错误消息：

* installing *source* package ‘plyr’ ...
** package ‘plyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
clang++  -I/opt/R-3.4.1/include -DNDEBUG  -I"/home/isomorphismes/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fpic  -I/opt/boost_1_61_0/boost -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
clang -I/opt/R-3.4.1/include -DNDEBUG  -I"/home/cd/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fpic  -g -O2 -flto -c loop_apply.c -o loop_apply.o
clang++  -I/opt/R-3.4.1/include -DNDEBUG  -I"/home/isomorphismes/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I/usr/local/include   -fpic  -I/opt/boost_1_61_0/boost -c split-numeric.cpp -o split-numeric.o
clang++ -shared -L/usr/local/lib -o plyr.so RcppExports.o loop_apply.o split-numeric.o
loop_apply.o: file not recognized: File format not recognized
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
/opt/R-3.4.1/share/make/shlib.mk:6: recipe for target 'plyr.so' failed
make: *** [plyr.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘plyr’
* removing ‘/home/cd/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.4/plyr’

*.o 文件位于/opt/plyr/src，来自 github.com/hadley/plyr。它们在我的系统上看起来像这样：

i@scheherezade:/opt/plyr/src$ file *o
loop_apply.o:    LLVM IR bitcode
RcppExports.o:   ELF 32-bit LSB relocatable, Intel 80386, version 1 (SYSV), not stripped
split-numeric.o: ELF 32-bit LSB relocatable, Intel 80386, version 1 (SYSV), not stripped

【问题讨论】：

标签： r linux build clang plyr

【解决方案1】：

如果您不知道，-flto 指定链接时间优化，并且已由 R 添加。您是如何设法以这种错误配置的 R 安装结束的？

将 -flto 添加到链接命令可能有效吗？或者从 loop_apply 编译行中删除它。如果其中任何一个工作，您需要修复您的 R 安装。

【讨论】：

哈。在这里忽略@TonyFischetti 的建议：onthelambda.com/2013/11/22/… 谢谢，DaBookshah。
我不确定如何更改安装过程（例如更改编译行或链接器），但在没有./configure --enable-lto 的情况下进行编译。我想这个问题提供了stackoverflow.com/questions/23736507/… 的答案？
*但是在没有./configure --enable-lto的情况下编译解决了它。
为了将来参考，您可以通过编辑 Makeconf 文件来更改包安装过程。在 Windows 上，它位于 /etc/x64/Makeconf 下。在其他平台上，它会在类似的地方。尽管编辑此文件可能不是解决您在此处给出的问题的推荐方法。
谢谢@DaBookshah！

【解决方案2】：

使用 clang 编译 -flto 需要（在 Ubuntu 上）安装 llvm-dev 包。否则，链接器无法处理-flto 目标文件。

apt-get install clang-10 llvm-10-dev

现在链接应该成功了。

【讨论】：