在 R 中将非标准文件转换为 .csv答案

【问题标题】：Converting non-standard file to .csv in R在 R 中将非标准文件转换为 .csv
【发布时间】：2015-07-14 06:02:51
【问题描述】：

我使用的一些输出文件是非标准的、以空格分隔的格式，具有非标准扩展名 (.out)，仅对我使用的特定程序有意义。例如，我可能会得到一个水预算输出文件，如下所示：waterbalance.out

我可以通过将文件作为空格分隔文件打开并在第 3 行开始导入来在 Excel 中打开这些文件。

如何将此类文件类型读入 R 以便转换为 .csv？

【问题讨论】：

您可以将sep 参数指定给read.csv 和fread（用于高效阅读器）。
我认为 R 可以毫无问题地处理非标准扩展。空间分隔的情况更加可怕。它不会聪明地处理模棱两可的情况，正如你所展示的那样，你可以轻松应对。
你可以试试read.table(yourfilename, sep = "\t", header=TRUE, comment.char = "0")（跳过以0开头的行，使用制表符作为分隔符）或read.table(yourfilename, sep = " ", header=TRUE, sip = 2)（跳过前两行，使用空格作为分隔符）。

【解决方案1】：

假设你有一个空格分隔的文件：

name grade percent
john 1 0.3
brian 2 0.25
joshua 5 1.1

您可以为read.csv 指定分隔符：

> read.csv("test.ssv", sep=" ")
    name grade percent
1   john     1    0.30
2  brian     2    0.25
3 joshua     5    1.10

另外，来自data.table 的fread 能够自动解析：

> library("data.table")
> fread("test.ssv")
     name grade percent
1:   john     1    0.30
2:  brian     2    0.25
3: joshua     5    1.10

【讨论】：