使用 RStudio 0.99.902 编译旧版 Sweave

Question

自 2009 年以来一直在 CRAN 上的“sos”包中的“sos”小插图有多个问题。我最近注意到它以多种方式失败，我不知道如何解决几个问题的问题。在 Mac OS X 10.11.5 下使用 R 3.3.0 在 RStudio 中的“sos.Rnw”上“编译 PDF”会产生一个 XQuartz 弹出窗口，如下所示：

>Sweave Noweb Syntax?
>>It seems you are using the Sweave-specific syntax in line(s) 
>>9, 15, <snip>;  you may need Sweave2knitr("sos.Rnw") to 
>>convert it to knitr'.  

按照它的要求，我做了以下事情：

Sweave2knitr('sos.Rnw')

这产生了一个文件'sos-knitr.Rnw'。我在 RStudio 中打开此文件并单击“编译 PDF”。我只有一行：

>Loading required package: knitr" 

如果我有别的东西，我不知道它去了哪里。

关于如何克服这个问题有什么建议吗？
谢谢，斯宾塞格雷夫斯

Answer 1

RStudio 默认使用knitr 而不是sweave 来生成代码。通过执行以下操作恢复此决定：

RStudio：

Tools -> Global Options -> Sweave -> Weave Rnw files using: Sweave