rmarkdown 文件 (.Rmd) 的 html 在浏览器中未正确显示答案

【问题标题】：html of rmarkdown file (.Rmd) is not displayed correctly in browserrmarkdown 文件 (.Rmd) 的 html 在浏览器中未正确显示
【发布时间】：2019-01-29 13:01:36
【问题描述】：

当我将 .Rmd 编织到 html 时，它无法正确显示，即。 e.格式似乎有问题（见下面的截图）：两个超链接不起作用，字体不是无衬线，没有目录等。我在另一台机器上使用了相同的代码 6 个月之前，它按预期呈现。然而，今天却没有。有人知道为什么 html 看起来很丑吗？它似乎不依赖于我打开 html 的浏览器（在 IE 和 Chrome 中测试过）。

这是我使用的代码：

---
title: "my title"
author: "subtitle"
date: "my name, `r format(Sys.time(), '%d. %B, %Y')`"
output:
  html_document:
    code_folding: hide
    highlight: haddock
    number_sections: yes
    toc: yes
    toc_float: yes
---

# section
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```{r, warning = FALSE}
head(mtcars)
```

还有我的会话信息：

> sessionInfo()
R version 3.4.2 (2017-09-28)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=German_Switzerland.1252  LC_CTYPE=German_Switzerland.1252    
LC_MONETARY=German_Switzerland.1252
[4] LC_NUMERIC=C                        LC_TIME=German_Switzerland.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] compiler_3.4.2  backports_1.1.1 magrittr_1.5    rprojroot_1.2   
htmltools_0.3.6 tools_3.4.2     yaml_2.1.15    
 [8] Rcpp_0.12.14    stringi_1.1.6   rmarkdown_1.8   knitr_1.17      
stringr_1.2.0   digest_0.6.12   evaluate_0.10.1

更新：在 Chrome 中打开 html，按 F12，在控制台下显示

【问题讨论】：

对我来说效果很好，看起来您的屏幕截图中缺少一些指向 javascript 或 css 参考的链接。生成的文件中是否无法使用javascript或所有css？
如何检查禁用的 javascript 和 css？我可以打开一个我在 6 个月前（在另一台机器上）编译的旧 .html，旧的 .html 看起来很好并且可以按预期工作。
对我来说也很好，使用 RStudio 的预览是否有效？
您可以尝试在旧机器上打开文件。或者您可以查看文件中的 html 代码，其中应该有一些 javascript 和 css，尤其是对于菜单。也许使用最新版本的 R 太 markdown 自 2017 年 9 月以来可能发生了很大变化
RStudio 中的预览也不起作用。 html中似乎缺少javascript。我该如何解决这个问题？

标签： html r r-markdown knitr

【解决方案1】：

我的一个朋友得到了这个问题的解决方案：我们公司的.libPaths()被定义为

.libPaths()
#> [1] "\\\\userhome/my_user_name/R/win-library/3.4"   # note the four \\\\
#> [2] "C:/Program Files/R/3.4.2/library"

将第一个位置更改为后

.libPaths()
#> [1] "C:/Users/my_user_name/R/win-library/3.4.2"     # path starts with C:/
#> [2] "C:/Program Files/R/3.4.2/library"

.Rmd 按预期呈现:)。

我们在.Rprofile 中放置了以下函数。它逐步创建目录并将其添加到.libPaths()。

# install packages locally within user profile
(function() {
  components <- list('C:/', 'users', Sys.info()['login'], 'R',
                     'win-library', paste0(R.Version()$major,
                                           '.',
                                           R.Version()$minor))

  # loop over components and create dir step-by-step
  # (recursive = TRUE leads to errors)
  for (k in 4:length(components)) {
    p <- do.call(file.path, components[1:k])
    dir.create(p, showWarnings = FALSE, recursive = FALSE)
  }

  path <- do.call(file.path, components)
  .libPaths(c(path, .Library))
})()

^{由reprex package (v0.2.1) 于 2018 年 9 月 24 日创建}

【讨论】：