连接的可视化——python、R、matlab？ [关闭]答案

【问题标题】：Visualisation of connections - python, R, matlab? [closed]连接的可视化——python、R、matlab？ [关闭]
【发布时间】：2015-03-09 18:15:15
【问题描述】：

我正在尝试寻找一种工具来可视化特定点之间的连接。我有一堆有时相互连接的数据点，我想创建这些连接的地图 - 可能是这样的：

您对此类工具有什么提示或建议吗？也许 python、R 或 matlab 中有一个模块或函数可以完成该任务。

【问题讨论】：

R 的 igraph 包或 python networkx 模块是不错的起点，但这些都必须在 google（甚至 SO）搜索中出现。您也可以只使用 gephi，因为这不需要编程技能。
看起来像 GraphViz 问题 - 查看 pydot 模块，pypi.python.org/pypi/pydot
GraphViz 绝对是我推荐的一个。这是 MATLAB 中的一个实现，有人试图模仿它在 MATLAB 中完全独立的样子：matlabtools.googlecode.com/svn/trunk/graphics/drawGraph.m

标签： python r matlab visualization

【解决方案1】：

有关 LinkedIn InMaps 的更多信息（2014 年 9 月关闭）：

http://www.quora.com/What-graphing-algorithm-does-Linkedin-inMaps-use

布局是优化的 Barnes-Hut 算法，颜色是选择使用 Louvain 优化模块化。虽然我们肯定玩过 Gephi 的一些较早的模拟项目，最终版本没有使用它。

InMaps 使用 Hadoop/Pig、Ruby、Voldemort、Java 和 Processing 繁重的后端地图计算和图像处理。探索小部件由 Javascript 和开源库 Seadragon 提供支持和 RaphaelJS。

核心程序员之一 Mathieu Bastien 在这里进行了技术演示：

http://www.slideshare.net/linkedin/linkedin-meetup-inmaps

他还是开源图形 GUI Gephi 的核心程序员：

https://gephi.github.io/

【讨论】：