dendrapply 错误：C 堆栈使用量太接近限制答案

【问题标题】：dendrapply Error: C stack usage is too close to the limitdendrapply 错误：C 堆栈使用量太接近限制
【发布时间】：2017-10-01 22:46:52
【问题描述】：

我这样使用R的dendrapply：

dendrapply(dendro, function(n) utils::str(attributes(n)))

其中dendro 是'dendrogram' with 2 branches and 5902 members total, at height 2。

运行一段时间后，它会因以下错误而崩溃：

Error: C stack usage  7971524 is too close to the limit

有什么想法吗？

【问题讨论】：

标签： r apply dendrogram

【解决方案1】：

看起来你有一个无限递归的情况，因为你的函数中没有返回节点。如果您只是想将每个节点的属性结构打印到控制台，请在函数中返回n，如下所示：

print_attrs <- function(n){
  utils::str(attributes(n))
  return(n)
}
dendrapply(dendro, print_attrs)

鉴于您的树状图的大小，这似乎最终会淹没控制台。创建每个节点的属性的平面（非嵌套）列表有点棘手，但一种方法是使用超赋值运算符<<- 在函数内修改函数的父框架中的变量：

list_attrs <- function(x){
  out <- vector(mode = "list", length = attr(x, "members"))
  counter <- 1
  get_node_attrs <- function(n){
    out[[counter]] <<- attributes(n)
    counter <<- counter + 1
    return(n)
  }
  tmp <- dendrapply(x, get_node_attrs)
  return(out)
}
myattributes <- list_attrs(dendro)

请注意，使用<<- 时应注意不要修改全局环境中的变量。请参阅this 帖子了解更多信息。

【讨论】：