【发布时间】:2019-05-08 01:24:49
【问题描述】:
我正在研究一个遗传学问题,我有 20 个基因,每个基因都有两个等位基因。这会产生 40 个可以是 1 或 0 的值。
对于这个分布,我得到 20 (np) 的期望值和 10 (np(1-p)) 的方差,因为 n=40 和 p= 0.5 (see here)。
但我会权衡每个基因的贡献。权重计算如下:
res <- optimize(function(lambda) (sum(exp(-lambda * (1:20))) -5)^2, 0:1, tol = .Machine$double.eps)
res
x <- c(1:20)
lambda <- res$minimum
y<-exp(-lambda*x)
请注意,由于每个基因都有 2 个等位基因,因此每个权重使用两次。
gene1.1 * weight1 + gene1.2 * weight 1 + gene2.1 * weight2 + gene2.2 * weight2...
我想计算这个新分布的期望值和方差,但我不确定如何在 R 中做到这一点。事实上,我根本不知道它的数学形式。
希望你能帮忙
【问题讨论】:
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函数
expo来自哪个包? -
那是一个错字,我现在已经修正了。我只是使用指数函数
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如果只是加权平均值和标准差的计算,那么这可能就足够了吗? stackoverflow.com/questions/10049402/…。如果它是加权分布族背后的方法,那么尝试将问题移至stats.stackexchange.com也许
标签: r statistics distribution variance