R 中与我的代码不匹配的意外符号错误答案

【问题标题】：Unexpected symbol error in R that doesn't match my codeR 中与我的代码不匹配的意外符号错误
【发布时间】：2019-05-09 11:40:58
【问题描述】：

我正在 R-studio 中编码，并且有一个名为 saveResults() 的函数。需要：

sce - 单细胞实验对象。
opt - 包含五件事的清单
clusterLabels - 包含两列的简单数据框

重要的是我收到一条错误消息：

Error: unexpected symbol in:
"saveResults(sce = sce, opt = opt, clusteInputs()
zhengMix"

这与我传递给函数的参数完全不同。您可以在下面代码块的最后一行看到这一点：我传递了正确的参数，但我收到一个错误，提示我传递了 clusteInputs() 和 zhengMix 而不是 clusterLabels。我没有名为clusteInputs() 的函数，而zhengMix 在上面几行。

# Save the clustering data
InstallAndLoadPackagesForSC3Clustering()
opt <- GetOptionInputs()
zhengMix <- FetchzhengMix(opt)
sce <- CreateSingleCellExperiment(zhengMix)
clusterLabels <- getClusterLabels(sce)
opt <- createNewDirectoriesToSaveData(opt)
saveResults <- function(sce, opt, clusterLabels){
    print("Beginning process of saving results...")
    maxClusters = ncol(clusterLabels)/2+1
    for (n in 2:maxClusters){
        savePCAasPDF(sce, opt, numOfClusters = n, clusterLabels)
        saveClusterLabelsAsRDS(clusterLabels, numOfClusters = n, opt)
    }
    saveSilhouetteScores(sce, opt)
    print("Done.")
}
saveResults(sce = sce, opt = opt, clusterLabels = clusterLabels)

有人知道发生了什么吗？我很坚持这一点。

【问题讨论】：

你是如何运行这段代码的。您是否复制/粘贴到 RStudio 中？好像你的输入在那里有一个坏字符。你试过重新输入吗？
我使用 bash 命令 Rscript 从终端调用 R 文件中的代码。
那么，您是在该文件中键入了所有这些命令还是在任何时候复制粘贴？听起来你只是在某个地方有一个错误的换行符。

标签： r debugging rstudio unexpected-token

【解决方案1】：

这不是最好的解决方案，但我通过从函数中删除代码并在那里运行它解决了我自己的问题，没有引起任何问题。

【讨论】：