针织返回解析错误答案

【问题标题】：Knitting returns parse error针织返回解析错误
【发布时间】：2015-09-28 09:24:21
【问题描述】：

在尝试编写 PDF 时。我正在调用一个脚本，该脚本应该通过调用块返回两个 ggplot：

```{r, echo=FALSE}

read_chunk('Script.R')

```r

但是收到错误

processing file: Preview-24a46368403c.Rmd

 Quitting from lines 9-12 (Preview-24a46368403c.Rmd)  Error in
 parse(text = x, srcfile = src) :    attempt to use zero-length
 variable name Calls: <Anonymous> ... <Anonymous> -> parse_all ->
 parse_all.character -> parse Execution halted

脚本自行运行并返回两个图，但在编织时不会返回它们。

同样尝试使用source() 但是遇到了类似的错误

 Quitting from lines 7-10 (Preview-24a459ca4c1.Rmd)  Error in
 file(filename, "r", encoding = encoding) :    cannot open the
 connection Calls: <Anonymous> ... withCallingHandlers -> withVisible
 -> eval -> eval -> source -> file Execution halted

【问题讨论】：

标签： r rstudio

【解决方案1】：

虽然这似乎不是您的解决方案，但如果块未正确结束，则会出现完全相同的错误消息。

我遇到了这个错误，并追踪到以 `` 而不是 ``` 结尾的块。更正块的语法解决了我遇到的与您相同的错误消息的问题。

【讨论】：

我猜这是这个错误最常见的原因。这对我有用。

【解决方案2】：

您确定 knitr 是从您认为的目录运行的吗？似乎找不到文件。

使用绝对路径，如果这样可以解决问题，您就找到了问题
一旦你这样做了，你可以使用opts_knit$set(root.dir = "...")——如果你想维护它（cwd），不要使用setwd(.)。

Knitr 的默认目录是.Rmd 文件本身的目录。

【讨论】：

我在这里添加了绝对路径：source("c:/users/me/documents/Script.R") opts_knit$set(root.dir = "c:/users/me/documents/") 但我仍然得到Quitting from lines 7-11 (Preview-24a43ec36ef0.Rmd) Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open the connection Calls: <Anonymous> ... write.csv -> eval.parent -> eval -> eval -> write.table -> file Execution halted1
知道了。您是否尝试过直接将 Script.R 的内容复制到 .Rmd 文件中？如果你有，并且可行，那么它肯定是 read_chunk 期望的和你传递的问题，但为了调试它，我们需要 Script.R 的内容

【解决方案3】：

这可能与划分代码块的三重反引号末尾的“r”有关。三重反引号后应该什么都没有，但我认为问题在于字母是“r”。

问题源于 R markdown 将以 r 开头的反引号语句处理为 inline code，这意味着它实际上运行反引号之间的任何内容。

我在使用此语句在 Rmd 中编写问题集时遇到了类似的问题，该语句的反引号文本旨在为等宽但不作为内联代码运行：

使用sapply 或map 计算故障率超过r <- seq(.05, .5, .025) 的概率。

当我编织文档时，我收到了不透明的错误消息，说我使用 <- 的分配不正确。这是因为 r <- seq(.05, .5, .025) 实际上被处理为 <- seq(.05, .5, .025) 的 R 内联代码，而不是仅在等宽中显示反引号语句...因此不正确的分配错误。我通过将变量名从 r 更改为 rate 来修复我的错误。

您问题中错误消息的实际文本可能是指代码块后面的任何内容，因为编织过程可能试图将其作为代码运行。在这种情况下，只需在代码块末尾删除那个杂散的r 即可修复错误。

【讨论】：

【解决方案4】：

你应该使用以下类似的语法，我有同样的问题，但已经解决了：

    ```{r views}
bank.df <- read.csv("C:/Users/User/Desktop/Banks.csv", header = TRUE) #load data
dim(bank.df) # to find dimension of data frame
head(bank.df) # show first six rows
```

``` 必须在行尾。

【讨论】：

【解决方案5】：

在我的情况下，我以四个昏迷结束了代码，而不是三个。检查此项，如果您也完成了四个昏迷，请尝试删除其中一个。

【讨论】：