在R中注释维恩图

【问题标题】：Annotate venn diagram in R在R中注释维恩图
【发布时间】：2015-07-02 21:13:18
【问题描述】：

我的问题涉及除了默认计数之外，如何使用实际值注释维恩图，使用任何 R 包。以下是数据的最小示例：

list.items <- list(method1=c("item1","item2","item3","item4","item5","item6"), 
                   method2=c("item1","item7","item3","item4","item8","item6"), 
                   method3=c("item1","item7","item9","item4","item10","item11"))
library(gplots)
venn(list.items)

这将返回维恩图：例如，我想看看 method3 实际上有哪些 3 个项目？例如第 3 项、第 5 项和第 7 项。

我想要一个维恩图，例如： http://openi.nlm.nih.gov/detailedresult.php?img=3026361_1471-2105-11-S6-S14-9&req=4 任何帮助将不胜感激。

【问题讨论】：

标签： r venn-diagram

【解决方案1】：

从文档中看来，使用 gtools 和 gplots 做你想做的事情是不可能的。可以使用vennDiagram 包或来自enter link description here R-Forge 的Vennerable。

但这是使用venneuler 包显示元素的一种方法。

library("venneuler")
df <- data.frame(method1=c("item1","item2","item3","item4","item5","item6"),
                 method2=c("item1","item7","item3","item4","item8","item6"),
                 method3=c("item1","item7","item9","item4","item10","item11"))
vd <- venneuler(df)
plot(vd)

【讨论】：

三个方法（不是项目）和三个圆圈内的项目应该是三个圆圈。