【问题标题】:R markdown with Latex on R studio cloud server在 R studio 云服务器上使用 Latex 进行 R 降价
【发布时间】:2020-04-19 13:02:28
【问题描述】:

我正在尝试在我们部门的 RStudio 服务器上使用 Rmarkdown。我正在使用 tinytex 包为 Rmarkdown 文件安装 TinyTex。它以前可以工作,然后我试图让一个自定义的乳胶模板工作,并以某种方式设法弄乱了我的乳胶设置。我尝试通过 tinytex 包重新安装 TinyTeX,但没有帮助。

编织时出现以下错误:

! kpathsea: Running mktexfmt pdflatex.fmt

! mktexfmt [ERROR]: -user mode but path setup is -sys type, bailing out.

附加信息:

1)

cat /proc/version

产量

Linux 版本 4.15.0-72-generic (buildd@lcy01-amd64-026) (gcc 版本 7.4.0 (Ubuntu 7.4.0-1ubuntu1~18.04.1)) #81-Ubuntu SMP Tue Nov 26 12: 2019 年 20:02 世界标准时间

2) 以下最小示例给出了相同的问题:

---
title: "Untitled"
output: pdf_document
---

## R Markdown

## Including Plots

5) 日志文件没有用,只包含上述错误消息

非常感谢任何帮助!

【问题讨论】:

    标签: r latex r-markdown pdflatex


    【解决方案1】:

    (目前)有点难以帮助您,因为您的帖子中几乎没有切实的信息。可能对我们有帮助的其他提示:

    1. 该服务器运行什么 Linux 发行版(和版本)?仅这一点就可能很重要——在 Debian/Ubuntu 上的 25 年 LaTeX 中,我几乎总是在发行版本身中找到所有必需的字体或样式(并且由于 IIRC 正交视图,tinytex 要么没有工作,要么不起作用路径信息是基于用户还是基于系统)。

    2. 您能否运行最小文档?如果你尝试一个五行的文档,也许只是设置文档类型、一个部分和一个标题,这样行吗?

    3. 您能否获取不同的设置来进行检查? https://rstudio.cloud 是一个相当不错的选择,仅用于检查您的尝试是否合理。

    4. Tinytex 尝试了一项艰巨的任务,即在所有可能的操作系统上拦截所有可能的错误。这很难甚至不可能做到正确;因此,它不止一次地欺骗了一位非常资深的 R 开发人员和我自己。

    5. 您是否有由您运行的命令生成的 .log 文件?有什么资料吗?

    tinytex 深受很多人的喜爱,它在某些情况下显然有帮助。也就是说,在 我的 用例中,它似乎会妨碍你,但不要让它阻止你。

    【讨论】:

    • 谢谢!更新了帖子。
    • 谢谢,现在我们知道了“Ubuntu”和 18.04。好的。接下来,您显示的是 RMarkdown 文档。要调试 (La)TeX,我建议只在 .tex 文件上运行 pdflatex。最后,现在我们知道它是 Ubuntu,我们可以更轻松地在 Docker 容器中进行测试。这一切都始于dpkg -l 'texlive*'。 (也就是说,我现在是 19.10,所以更新了三个版本,并且一些包已经改变......)
    • .tex 文件上的 pdflatex。 :这给出了:kpathsea: Running mktexfmt pdflatex.fmt mktexfmt [ERROR]: -user mode but path setup is -sys type, bailing out. I can't find the format file `pdflatex.fmt'!。和以前一样,运行 ``` dpkg -l 'texlive*'``` 给了我一堆我猜的 TeX 包——大约 8 个,但我不知道这对我有什么帮助。
    • 这很有帮助。您基本上需要与 工作 和可比较的安装进行比较。那么也许是rstudio.cloud?当我运行 dpkg -l | grep texlive | wc -l 时,我得到 18 包(在 Ubuntu 16.04 上)。在我的服务器上,我有 27 个包。所以 8 听起来太少了,如果基本乳胶不起作用我们应该从那里开始。你能找到你的系统管理员吗?
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