对矩阵列名进行排序以匹配列表中的元素顺序答案

【问题标题】：Sort matrix colnames to match element order in a list对矩阵列名进行排序以匹配列表中的元素顺序
【发布时间】：2021-08-22 00:47:31
【问题描述】：

我有一个特定的列表，例如：

my_list<-list("Cluster18904", "Cluster6294", "Cluster17424", "Cluster26257", 
     "Cluster27053", "Cluster2905", "Cluster16096", "Cluster14552")

看起来像：

my_list

[[1]]
[1] "Cluster18904"

[[2]]
[1] "Cluster6294"

[[3]]
[1] "Cluster17424"

[[4]]
[1] "Cluster26257"

[[5]]
[1] "Cluster27053"

[[6]]
[1] "Cluster2905"

[[7]]
[1] "Cluster16096"

[[8]]
[1] "Cluster14552"

我有一个具有相同列名的矩阵，但我正在寻找一种解决方案，以便对矩阵的列进行排序以匹配与my_list中相同的顺序

我试过了：

as.data.frame(matrix)[,my_list]

但我明白了：

.subset(x, j) 中的错误：'list' 不正确的索引类型

【问题讨论】：

标签： r dataframe matrix

【解决方案1】：

我们需要unlist

as.data.frame(matrix)[, unlist(my_list)]

如果有列名不匹配，则使用intersect

dat1 <- as.data.frame(matrix)
nm1 <- intersect(names(dat1), unlist(my_list))
dat1[nm1]

【讨论】：

【解决方案2】：

另一个基本 R 选项

as.data.frame(matrix)[simplify2array(my_list)]

【讨论】：

【解决方案3】：

这将根据列表名称对列名称进行排序，首先将列表名称转换为字符串向量。

matrix[,match(colnames(matrix),as.character(my_list))]

【讨论】：