从矩阵中提取行名和列名及其值答案

【问题标题】：Extracting row and column names with its value from matrix从矩阵中提取行名和列名及其值
【发布时间】：2019-09-11 12:38:35
【问题描述】：

我的矩阵是这样的-

          MU101188  MU101310    MU101326    MU10251
MU101188    1        0.506       -0.006     -0.006
MU101310   -0.006       1        -0.006     -0.006
MU101326  -0.006    -0.006            1     -0.006
MU10251   -0.006    -0.006        0.806         1

我需要提取其值大于或等于 0.5 的所有对。我正在使用以下 R 脚本，它给了我行和列的名称，但我还想要第三列包含它的值

Pmatrix = read.csv ("file.csv", header= TRUE, row.names = 1)
sig_values <- which(Pmatrix>=0.5, arr.in=TRUE)
cbind.data.frame(colIDs = colnames(Pmatrix)[ sig_values[, 1] ],rowIDs = rownames(Pmatrix)[ sig_values[, 2] ] )

【问题讨论】：

标签： r csv matrix row col

【解决方案1】：

您可以使用 sig_values 子集 Pmatrix

cbind.data.frame(colIDs = colnames(Pmatrix)[sig_values[, 1]],
                 rowIDs = rownames(Pmatrix)[sig_values[, 2]], 
                 values = Pmatrix[sig_values])


#    colIDs   rowIDs values
#1 MU101188 MU101188  1.000
#2 MU101188 MU101310  0.506
#3 MU101310 MU101310  1.000
#4 MU101326 MU101326  1.000
#5  MU10251 MU101326  0.806
#6  MU10251  MU10251  1.000

【讨论】：