如何创建一个只有整数的表答案

【问题标题】：How to create a table with only integers如何创建一个只有整数的表
【发布时间】：2021-12-23 03:25:18
【问题描述】：

我有一张表格，其中包含样本的分类 [chr] 和存在/absebce 数据 [num]。我从 .tsv 文件中导入了它。它是一个包含 x 个观测值和 y 个变量的表。我必须将其转换为仅以整数作为条目的表格。

我试过lapply(data,as.integer)，它适用于存在/不存在数据的列，但在分类列中，我的数据消失了，我有 NA 而不是物种。更重要的是，我不再有表格，而是有 y 个变量的列表。

还有其他方法可以做到吗？

taxonomy	site1	site2	site3	site4
species1	0	1	0	0
species2	1	0	0	0
species3	0	1	1	1

lapply(data,as.integer) 之后是这样的：

taxonomy	site1	site2	site3	site4
NA	0	1	0	0
NA	1	0	0	0
NA	0	1	1	1

【问题讨论】：

lapply(data[,2:5],as.integer)
感谢您的评论，但我需要将第一列放在表格中。

标签： r dplyr tidyr

【解决方案1】：

使用dplyr，您可以...

library(dplyr)

# everything except the first column
mtcars %>%
  mutate(across(-1, as.integer))

# everything except "taxonomy"
mtcars %>%
  mutate(across(-taxonomy, as.integer))

# everything that starts with "site"
data %>%
  mutate(across(starts_with("site"), as.integer))

我会质疑您的数据中的内容，以使其首先被视为字符。我的猜测是有一些“NA”字符。如果您使用的是read.table()，您可能需要调整参数na.strings = "NA"，使其首先以整数形式读入。

【讨论】：

感谢您的意见。

【解决方案2】：

如果我们想使用基础 R，我们可以使用 lapply 并将输出分配给数据的子集：

data[-1]<-lapply(data[-1], as.integer)
data

【讨论】：

【解决方案3】：

我想我现在知道问题出在哪里 - 我需要在第一列中使用分类名称作为我的表中的标签。

使用read.csv('data.csv', header = TRUE, row.names = 1) 读取数据确实有帮助。

【讨论】：