在 Stata 中运行 R 脚本 - “权限被拒绝”答案

【问题标题】：Running R Script within Stata - "permission denied"在 Stata 中运行 R 脚本 - “权限被拒绝”
【发布时间】：2018-01-12 09:31:31
【问题描述】：

我正在做一个需要在 Stata 中运行 R 脚本的项目。我写了以下代码：

shell "/Users/alexanderrbilly/Desktop/Neel/cleaner.R" CMD BATCH "cleaner.R"

尽管在此之前更改了命令目录（这无关紧要），但我仍然收到相同的错误：

/bin/bash: /Users/alexanderrbilly/Desktop/Neel/cleaner.R: Permission denied

如果我做错了什么，或者我可以如何解决这个问题，请告诉我。

【问题讨论】：

您不会调用 R 可执行文件，而只是调用只是一个文本文件的脚本。考虑自动 Rscript：/path/to/Rscript /path/to/cleaner.R

标签： r shell stata

【解决方案1】：

你的命令行不正确。

您的字符串 "/Users/alexanderrbilly/Desktop/Neel/cleaner.R" 应该是您的 R 可执行文件的路径。

如果您使用的是 Windows。假设文件K:\tmp\random.R 包含代码write.csv(rnorm(10), "a.csv")。然后，你可以在Stata中写：

cd K:\tmp
shell C:\APPLI\R\R-3.4.1\bin\x64\R.exe CMD BATCH random.R

当然，更改 R 可执行文件的路径以适合您的安装。

【讨论】：

酷！我使用file.path(R.home("bin"), "R") 来识别 R 可执行路径，它现在似乎正在工作（对于那些不确定如何提取路径的人）。我使用了此页面中的信息：Reference
所以你在 macOS 上。问题并没有太大的不同，但你必须找到路径，如果 R 不在 PATH 环境变量中：在终端中，命令“R”会启动什么吗？您也可以启动 R 应用程序并键入 Sys.getenv("PATH") 以找出可执行文件的位置。
哦，我没看到你改变了你的评论。这是另一种查找方式。
@JuliusBilly 您可能还对来自 ssc 的包 rsource 感兴趣。有关更多信息，请在 Stata 中键入 ssc describe rsource。要安装，请输入ssc install rsource。