【问题标题】:scatterplot with alpha transparent histograms in RR中带有alpha透明直方图的散点图
【发布时间】:2013-06-26 13:35:54
【问题描述】:

如何在 R 中制作具有 alpha 透明、无比例直方图的散点图,就像这个图?

好像不是ggplot2.

有人知道用什么命令吗?

【问题讨论】:

标签: r plot ggplot2


【解决方案1】:
library(ggplot2)
library(gridExtra)

set.seed(42)
DF <- data.frame(x=rnorm(100,mean=c(1,5)),y=rlnorm(100,meanlog=c(8,6)),group=1:2)

p1 <- ggplot(DF,aes(x=x,y=y,colour=factor(group))) + geom_point() +
  scale_x_continuous(expand=c(0.02,0)) +
  scale_y_continuous(expand=c(0.02,0)) +
  theme_bw() +
  theme(legend.position="none",plot.margin=unit(c(0,0,0,0),"points"))

theme0 <- function(...) theme( legend.position = "none",
                               panel.background = element_blank(),
                               panel.grid.major = element_blank(),
                               panel.grid.minor = element_blank(),
                               panel.margin = unit(0,"null"),
                               axis.ticks = element_blank(),
                               axis.text.x = element_blank(),
                               axis.text.y = element_blank(),
                               axis.title.x = element_blank(),
                               axis.title.y = element_blank(),
                               axis.ticks.length = unit(0,"null"),
                               axis.ticks.margin = unit(0,"null"),
                               panel.border=element_rect(color=NA),...)

p2 <- ggplot(DF,aes(x=x,colour=factor(group),fill=factor(group))) + 
  geom_density(alpha=0.5) + 
  scale_x_continuous(breaks=NULL,expand=c(0.02,0)) +
  scale_y_continuous(breaks=NULL,expand=c(0.02,0)) +
  theme_bw() +
  theme0(plot.margin = unit(c(1,0,0,2.2),"lines")) 
  
p3 <- ggplot(DF,aes(x=y,colour=factor(group),fill=factor(group))) + 
  geom_density(alpha=0.5) + 
  coord_flip()  + 
  scale_x_continuous(labels = NULL,breaks=NULL,expand=c(0.02,0)) +
  scale_y_continuous(labels = NULL,breaks=NULL,expand=c(0.02,0)) +
  theme_bw() +
  theme0(plot.margin = unit(c(0,1,1.2,0),"lines"))

grid.arrange(arrangeGrob(p2,ncol=2,widths=c(3,1)),
             arrangeGrob(p1,p3,ncol=2,widths=c(3,1)),
             heights=c(1,3))

编辑:

我无法找出导致密度几何图形下方空间的原因。你可以摆弄情节边距来避免它,但我真的不喜欢那样。

p2 <- ggplot(DF,aes(x=x,colour=factor(group),fill=factor(group))) + 
  geom_density(alpha=0.5) + 
  scale_x_continuous(breaks=NULL,expand=c(0.02,0)) +
  scale_y_continuous(breaks=NULL,expand=c(0.00,0)) +
  theme_bw() +
  theme0(plot.margin = unit(c(1,0,-0.48,2.2),"lines")) 

p3 <- ggplot(DF,aes(x=y,colour=factor(group),fill=factor(group))) + 
  geom_density(alpha=0.5) + 
  coord_flip()  + 
  scale_x_continuous(labels = NULL,breaks=NULL,expand=c(0.02,0)) +
  scale_y_continuous(labels = NULL,breaks=NULL,expand=c(0.00,0)) +
  theme_bw() +
  theme0(plot.margin = unit(c(0,1,1.2,-0.48),"lines"))

【讨论】:

  • 非常好!但是,如何使密度图更靠近轴,以便它们像原始图中一样触及图的边界框?
【解决方案2】:

我不知道是否有直接执行此操作的包,但我确信这可以在 R 中完成。透明度很容易:您在 RGB 规范中添加另外两位数给定透明度的颜色:

#FF0000 # red
#FF0000FF # full opacity
#FF000000 # full transparency

使用layout 函数也可以轻松组合不同的图。至于垂直密度图,它与 x 和 y 切换的水平图相同。 here 给出的示例可以很容易地扩展为包括颜色、较小的边距等。如果此描述不充分,我可以尝试提出更详细的示例。

【讨论】:

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