在anaconda python中手动删除pkgs文件夹中的所有文件是否安全？答案

【问题标题】：Is it safe to manually delete all files in pkgs folder in anaconda python?在anaconda python中手动删除pkgs文件夹中的所有文件是否安全？
【发布时间】：2019-10-09 11:56:16
【问题描述】：

我运行这个命令来释放 anaconda 上的磁盘空间

$ conda clean -all

但是，anaconda python 的pkgs 文件夹中仍有一些大文件。

手动删除pkgs文件夹中的所有文件是否安全？有损坏我的 anaconda 环境的风险吗？有什么副作用（如果有的话）？

我在 Windows 10 上使用 anaconda 2018。

【问题讨论】：

从个人经验来说，我已经删除了pkgs文件夹中的所有文件，没有遇到任何问题。但是，如果您有疑问，请不要理会这些文件。我在这里分享我自己的经验，不能保证如果你这样做不会遇到问题。我正在使用 Windows 10。
只是想指出我还删除了 pkgs 中的所有文件，没有明显问题。这是在运行某种 Debian 的集群上，只使用一个 conda env。它绝对可以释放空间 - 我们有严格的配额限制，它非常有用
@Clumsy 猫，我做过很多次。完全没问题。

标签： python anaconda

【解决方案1】：

编辑评论

在查看了in @Robert's answer 指出的文档后，我必须承认我最初的反应过于危言耸听，并且在某些方面明显不正确。对于误导性的回复，我深表歉意。

尽管如此，我确实相信我提出的一些内容对于这个线程仍有一些价值，因此我决定保留修改后的答案。特别是，我认为值得强调的是，删除pkgs 目录实际上可能无法实现 OP 所希望的（以节省空间），并且删除包缓存会破坏 Conda 的冗余最小化策略，因为它无法共享已安装的包。

相反，我的最终建议与@Robert 的建议一致，即使用conda clean -p 删除未使用的包，但保留缓存（pkgs dir），以便将来的环境仍然可以利用硬链接。最后要注意的一点是，某些工具（例如 conda-pack）依赖于包缓存的完整性才能正常工作，因此删除 pkgs 会阻止它们的使用。

修改后的原始回复

~~不，这绝对不安全，事实上，真正释放磁盘空间的唯一方法是破坏 base 环境。~~ 问题是所有envs 使用到 pkgs 目录的硬链接，因此即使您删除了位于 pkgs 目录中的 link，envs 中的链接仍然存在，因此您不会删除任何物理磁盘上的文件。 ~~你可能做的唯一真正的删除是只有 base 引用的东西，即唯一的副本是在pkgs，因此可能会破坏 base.~~

更正：base 环境仍将包链接到其他位置，因此删除 pkgs 不会影响 base，正如我最初得出的结论。

我强烈建议您查看this other post on estimating the real disk usage of Conda。您可能高估了实际使用了多少空间。对于pkgs 中的大多数文件，只有一个物理副本，因此无需进行任何额外的手动优化。

【讨论】：

天哪。我刚刚删除了 pkgs 文件夹中的所有文件。到目前为止，我仍然可以正常使用 conda python 而不会打嗝。我怀疑这是因为我不使用虚拟环境。我只有 1 个单一的 conda 基础环境。那么，如果我只有一个基本环境，那么删除文件应该没有关系？
@user781486 有趣的是看看一切是否仍然有效。也许 base 还有其他我不知道的链接。如果您真的想节省空间，请考虑migrating to Miniconda。在您的情况下，您可能甚至不想导出 YAML，因为听起来您只有 Anaconda。你可以只列出你实际使用的包，然后开始制作新的环境。
我认为即使是基本环境也可以根据您的操作系统将 pkgs 目录中的文件硬链接到适当的位置。因此，您没有遇到任何问题。
@user781486 我怀疑您是否节省了任何物理空间，而只是创建了这样做的外观。我仍然坚信，如果您确实节省了空间，您可能会弄坏一些东西。您还可能创建了一种情况，即在创建新环境时，Conda 可能不再能够重用您当前拥有的包。但是您需要运行类似于我建议的测试来验证这一点。
@user781486 在查看了this answer 中发布的内容后，我决定编辑我的答案。我认为您将接受的答案更改为该答案而不是我的答案是合适的。幸运的是，我认为我在谨慎方面犯了错误，但我仍然必须承认：我错了，我为误导你而道歉。

【解决方案2】：

实际上，在某些情况下，可以选择删除 pkgs 子目录。正如 Anaconda 社区支持here 所述，“pkgs 目录只是一个缓存。您可以根据需要完全删除它。但是，在创建新环境时，将缓存中的任何包留在周围会更有效。”

根据documentation，您可以使用conda clean --packages 删除pkgs 中未使用的包（这会将它们移动到pkgs/.trash，然后您可以从中安全地删除它们）。虽然这不会检查使用符号链接安装的包返回包缓存，但如果您不使用此类环境或在 Windows 下工作，这不是主题。我想这就是conda clean --packages 包含在conda clean --all 中的原因。

为了更积极地节省空间，您可以使用conda clean --force-pkgs-dirs 删除所有可写包缓存（同样需要注意的是可能存在链接到这些目录的环境）。如果您不使用环境或在 Windows 下使用 Anaconda，您可能是安全的。就个人而言，我使用此选项没有问题。

【讨论】：

我在 Windows 下使用 Anaconda。我经常删除 pkgs 文件夹中的所有文件。目前完全没有问题。