【发布时间】:2019-01-16 04:31:02
【问题描述】:
我正在尝试使用 reshape2 中的 dcast 将数据帧从长格式转换为宽格式。数据是医院就诊日期和诊断列表。 (Dx.num 列出了单次就诊中的诊断序列。如果同一患者返回,则此变量重新开始,新就诊的主要诊断从 1 开始。)我希望每个人有一行(id) .数据结构为:
id visit.date visit.id bill.num dx.code FY Dx.num
1 1/2/12 203 1234 409 2012 1
1 3/4/12 506 4567 512 2013 1
2 5/6/18 222 3452 488 2018 1
2 5/6/18 222 3452 122 2018 2
3 2/9/14 567 6798 923 2014 1
我想我最终会得到这样的列:
id, date_visit1, date_visit2, visit.id_visit1, visit.id_visit2, bill.num_visit1, bill.num_visit2, dx.code_visit1_dx1, dx.code_visit1_dx2 dx.code_visit2_dx1, FY_visit1_dx1, FY_visit1_dx2, FY_visit2_dx1
最初,我尝试创建一个这样的 visit_dx 列:
**visit.dx**
v1dx1 (visit 1, dx 1)
v2dx1 (visit 2, dx 1)
v1dx1 (...)
v1dx2
v1dx1
并使用以下代码,从 DF 中省略“Dx.num”,因为它在“visit.dx”中有所说明:
wide <-
dcast(
setDT(long),
id + visit.date + visit.id + bill.num ~ visit.dx,
value.var = c(
"dx.code",
"FY"
)
)
当我运行它时,我收到警告“缺少聚合函数,默认为 'length'”和充满 0 和 1 的新数据框。但是,数据框中没有重复的行。我开始认为我应该完全不同地处理这个问题。
任何帮助将不胜感激。
【问题讨论】:
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我认为 reshape2 的 dcast 不支持多个 value.var,但您可以使用 data.table:
library(data.table); dcast(setDT(DF), id ~ rowid(id), value.var=setdiff(names(DF), "id")).. 不确定这是否是您所追求的。详情:stackoverflow.com/q/23056328