【发布时间】:2017-03-04 06:15:07
【问题描述】:
我的团队正在构建一个 ETL 流程,以使用 Spark 将原始分隔文本文件加载到基于 Parquet 的“数据湖”中。 Parquet 列存储的承诺之一是查询只会读取必要的“列条纹”。
但我们看到为嵌套架构结构读取了意外的列。
为了演示,这里是一个使用 Scala 和 Spark 2.0.1 shell 的 POC:
// Preliminary setup
sc.setLogLevel("INFO")
import org.apache.spark.sql.types._
import org.apache.spark.sql._
// Create a schema with nested complex structures
val schema = StructType(Seq(
StructField("F1", IntegerType),
StructField("F2", IntegerType),
StructField("Orig", StructType(Seq(
StructField("F1", StringType),
StructField("F2", StringType))))))
// Create some sample data
val data = spark.createDataFrame(
sc.parallelize(Seq(
Row(1, 2, Row("1", "2")),
Row(3, null, Row("3", "ABC")))),
schema)
// Save it
data.write.mode(SaveMode.Overwrite).parquet("data.parquet")
然后我们将文件读回 DataFrame 并投影到列的子集:
// Read it back into another DataFrame
val df = spark.read.parquet("data.parquet")
// Select & show a subset of the columns
df.select($"F1", $"Orig.F1").show
当它运行时,我们会看到预期的输出:
+---+-------+
| F1|Orig_F1|
+---+-------+
| 1| 1|
| 3| 3|
+---+-------+
但是...查询计划显示的情况略有不同:
“优化方案”显示:
val projected = df.select($"F1", $"Orig.F1".as("Orig_F1"))
projected.queryExecution.optimizedPlan
// Project [F1#18, Orig#20.F1 AS Orig_F1#116]
// +- Relation[F1#18,F2#19,Orig#20] parquet
并且“解释”显示:
projected.explain
// == Physical Plan ==
// *Project [F1#18, Orig#20.F1 AS Orig_F1#116]
// +- *Scan parquet [F1#18,Orig#20] Format: ParquetFormat, InputPaths: hdfs://sandbox.hortonworks.com:8020/user/stephenp/data.parquet, PartitionFilters: [], PushedFilters: [], ReadSchema: struct<F1:int,Orig:struct<F1:string,F2:string>>
并且执行过程中产生的INFO日志也证实了Orig.F2列被意外读取:
16/10/21 15:13:15 INFO parquet.ParquetReadSupport: Going to read the following fields from the Parquet file:
Parquet form:
message spark_schema {
optional int32 F1;
optional group Orig {
optional binary F1 (UTF8);
optional binary F2 (UTF8);
}
}
Catalyst form:
StructType(StructField(F1,IntegerType,true), StructField(Orig,StructType(StructField(F1,StringType,true), StructField(F2,StringType,true)),true))
根据Dremel paper 和Parquet documentation,复杂嵌套结构的列应该独立存储和独立检索。
问题:
- 此行为是否是当前 Spark 查询引擎的限制?换句话说,Parquet 是否支持优化执行此查询,但 Spark 的查询计划器很幼稚?
- 或者,这是当前 Parquet 实现的限制吗?
- 或者,我没有正确使用 Spark API?
- 或者,我是否误解了 Dremel/Parquet 列存储的工作原理?
可能相关:Why does the query performance differ with nested columns in Spark SQL?
【问题讨论】:
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这是 Spark 查询引擎的问题。
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@LostInOverflow,你知道这是否在 Spark 问题跟踪器中吗? issues.apache.org/jira/browse/SPARK/…
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根据@julien-le-dem twitter.com/J_/status/789584704169123841,Parquet 似乎应该支持这种情况@
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github.com/apache/spark/pull/16578 解决了这个问题。
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更新。之前的 PR 已经关闭,没有解决,新的简化 PR 已经打开。在此处跟踪新的:github.com/apache/spark/pull/21320
标签: apache-spark spark-dataframe parquet