【发布时间】:2014-09-16 07:37:48
【问题描述】:
我在集群上安装了 R,并使用 Rstudio 服务器来编辑我的 R 程序。 rstudio-server 通过浏览器运行。
一切正常,除了“情节”。
我尝试绘制,例如使用 R 样本数据:
plot(cars)
它会返回:
24 Jul 2014 15:58:37 [rsession-ubuntu] ERROR r error 4 (R code execution error) [errormsg=Error in grDevices:::png("/tmp/RtmpWjMGwA/6bca9fa4842a42418ab83d2c0ef7453b.png", :
X11 is not available
]; OCCURRED AT: core::Error r::exec::evaluateString(const std::string&, SEXPREC**, r::sexp::Protect*) /home/ubuntu/rstudio/src/cpp/r/RExec.cpp:266; LOGGED FROM: DevDesc* r::session::graphics::handler::shadow::<unnamed>::shadowDevDesc(DevDesc*) /home/ubuntu/rstudio/src/cpp/r/session/graphics/RShadowPngGraphicsHandler.cpp:141
Error in RStudioGD() :
Shadow graphics device error: r error 4 (R code execution error)
能力展示:
> capabilities()
jpeg png tiff tcltk X11 aqua http/ftp sockets libxml fifo cledit iconv NLS profmem cairo
FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE
有没有人使用 rstudio-server 创建绘图?请帮忙! 谢谢!
更新
我稍微修改了标题。因为我发现它似乎不仅仅是一个 Rstudio 服务器问题。我用“--with-x=yes”重新安装了 R。 (我之前使用“--with-x=no”安装 R 以避免“X11 标头/库错误”问题。)
现在错误变为:
Error in .External2(C_X11, d$display, d$width, d$height, d$pointsize, :
unable to start device X11
In addition: Warning message:
In X11() : unable to open connection to X11 display ''
更新 2
我已经让 R on cluster 与地块一起工作。但在 rstudio 部分,仍然没有运气。
我将 xming 服务器安装为 SSH 绘图视图窗口。并在putty中配置X显示值。现在我可以在 Xming 窗口上显示地块(汽车)了。
对于rstudio,我不知道如何启用x11。有人知道吗?请帮忙!
【问题讨论】:
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@jdharrison,我浏览了 rstudio 网站上的常见问题解答,我还没有找到任何可靠的解决方案来解决这个问题。我什至安装了 x11,但它没有帮助。
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我在编译R安装包的时候设置了--with-x=no。我使用 --with-x=no 因为我无法通过“X11 headers/libs are not available 问题。我可以重新打开 X11 功能吗?
标签: r plot rstudio-server