使用 ADD=Shiny 和摇滚诗图像添加闪亮的服务器答案

【问题标题】：Add shiny server with ADD=Shiny with rocker verse image使用 ADD=Shiny 和摇滚诗图像添加闪亮的服务器
【发布时间】：2021-04-15 04:56:03
【问题描述】：

Documentation for rocker/rstudio docker container.

我可以使用 Docker 在 rstudio 中启动并运行，并在目录中设置了以下内容：

Dockerfile：

FROM rocker/tidyverse:latest

码头工人撰写：

version: "3.5"
services:
  ide-rstudio:
    build:
      context: .
    ports:
      - 8787:8787
    environment:
      ROOT: "TRUE"
      PASSWORD: test

现在，如果我在终端中输入此目录并键入：docker-compose build，然后是 docker-compose up -d，然后导航到 localhost:8787，我会看到 rstudio 登录屏幕。到目前为止一切顺利。

我想根据文档将闪亮添加到同一个容器（而不是使用单独的闪亮图像）。

在我链接到的文档顶部它说：

使用 e ADD=shiny 在启动时添加闪亮的服务器

docker run -d -p 3838:3838 -p 8787:8787 -e ADD=shiny -e PASSWORD=yourpasswordhere rocker/rstudio

闪亮的服务器现在在 localhost:3838 上运行，RStudio 在 localhost:8787 上运行。

由于我使用的是 docker-compose，我将 docker-compose 文件更新为：

version: "3.5"
services:
  ide-rstudio:
    build:
      context: .
    ports:
      - 8787:8787
      - 3838:3838
    environment:
      ROOT: "TRUE"
      ADD: "shiny"
      PASSWORD: test

现在，当我像以前一样进入终端并输入：docker-compose build，然后是 docker-compose up -d，我再次在 localhost:8787 看到 rstudio 登录页面。但是，如果我转到 localhost:3838，我会看到 Firefox 的“连接已重置”页面。好像什么都没有。

如何按照说明为我的容器添加光泽？

【问题讨论】：

标签： r docker shiny docker-compose rstudio

【解决方案1】：

该图像似乎缺少闪亮的安装程序。如果您在没有-d 并使用rocker/rstudio:3.2.0 图像的情况下运行相同的撰写文件，您将在日志中看到shiny 正在安装。它无法为我安装（缺少文件/usr/local/lib/R/site-library/littler/examples/install2.r 存在问题），但我找到了安装该东西的脚本。由于某种原因，rocker/tidyverse:latest 中不存在该脚本（我不知道为什么，您最好询问维护者）并且ADD=shiny 没有效果。

我设法通过将该脚本注入rocker/tidyverse:latest 来使事情正常进行，您可以这样做。将以下内容另存为名为@987654328@的文件：

#!/usr/bin/with-contenv bash

ADD=${ADD:=none}

## A script to add shiny to an rstudio-based rocker image.

if [ "$ADD" == "shiny" ]; then
  echo "Adding shiny server to container..."
  apt-get update && apt-get -y install \
    gdebi-core \
    libxt-dev && \
    wget --no-verbose https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/VERSION -O "version.txt" && \
    VERSION=$(cat version.txt)  && \
    wget --no-verbose "https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-$VERSION-amd64.deb" -O ss-latest.deb && \
    gdebi -n ss-latest.deb && \
    rm -f version.txt ss-latest.deb && \
    install2.r -e --skipinstalled shiny rmarkdown && \
    cp -R /usr/local/lib/R/site-library/shiny/examples/* /srv/shiny-server/ && \
    rm -rf /var/lib/apt/lists/* && \
    mkdir -p /var/log/shiny-server && \
    chown shiny.shiny /var/log/shiny-server && \
    mkdir -p /etc/services.d/shiny-server && \
    cd /etc/services.d/shiny-server && \
    echo '#!/bin/bash' > run && echo 'exec shiny-server > /var/log/shiny-server.log' >> run && \
    chmod +x run && \
    adduser rstudio shiny && \
    cd /
fi

if [ $"$ADD" == "none" ]; then
       echo "Nothing additional to add"
fi

然后将以下内容添加到您的Dockefile：

COPY add /etc/cont-init.d/add
RUN chmod +x /etc/cont-init.d/add

或在本地应用执行权限并在运行时挂载它。为此，请在本地运行以下命令：

chmod +x add

并将其添加到docker-compose.yml:

services:
  ide-rstudio:
    volumes:   # this line and below
    - ./add:/etc/cont-init.d/add

【讨论】：