在没有 Internet 访问的 AWS-VPC 上运行 R-Notebook

Question

我在没有互联网访问的 AWS-VPC 上运行 RStudio-server。当我尝试打开一个新的 R-Notebook 时，它卡在了加载轮屏幕上。我有两个假设：

1. RStudio 尝试连接到 Internet（出于某种原因）。既然不行，就卡住了；
2. 依赖性问题。

其他一切正常（普通的 R 脚本）。

为 RStudio 提供服务的机器是一个带有 Ubuntu 16 的 EC2 实例，我通过同一 VPC 中的一个 Windows Server 2008 实例进行连接。

任何替代假设？

Answer 1

两者兼而有之。它可能缺少依赖项，因此它尝试连接到 Internet 以下载它们。等待是因为它在超时之前等待来自远程服务器的响应。

rmarkdown 具有以下依赖关系：

• 工具
• 实用工具
• knitr (≥ 1.14)
• yaml (≥ 2.1.5)
• htmltools (≥ 0.3.5)
• caTools
• 评估（≥ 0.8）
• base64enc
• jsonlite
• rprojroot
• 方法

如果你等待它超时，它会告诉你丢失了哪些包。

可以通过设置来缓解等待时间：

options(repos = NULL)

这将立即带来错误消息（并停止 URI 查找）

我没有尝试将存储库设置为指向本地 CRAN 存储库（使用 miniCRAN 制作），但最安全的方法是将其设置为 NULL，然后通过 R CMD INSTALL <package.tar.gz> 手动安装缺少的存储库