【问题标题】:curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) : Unrecognized content encoding type. libcurl understands deflate, gzip content encodingscurl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) :无法识别的内容编码类型。 libcurl 理解 deflate、gzip 内容编码
【发布时间】:2021-01-22 20:52:36
【问题描述】:

我正在尝试使用 RCY3 包创建 Cytoscape 网络。当我运行以下代码时,我收到以下错误消息-

createNetworkFromDataFrames(edges = edge_df, nodes = NULL, title = "基因共表达网络")

curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) 中的错误:无法识别的内容编码类型。 libcurl 理解 deflate、gzip 内容编码。


追溯: curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) 中的错误:无法识别的内容编码类型。 libcurl 理解 deflate、gzip 内容编码。 7. curl::curl_fetch_memory(url,句柄=句柄) 6.request_fetch.write_memory(req$output, req$url, 句柄) 5.request_fetch(req$output, req$url, 句柄) 4.request_perform(req, hu$handle$handle) 3.POST(url = URLencode(q.url), body = q.body, 编码 = "json", content_type_json()) 2.cyrestPOST("networks", parameters = list(title = title, collection = collection), body = json_network, base.url = base.url) 1.createNetworkFromDataFrames(edges = edge_df, nodes = NULL, title = "基因共表达网络")


curl 包已安装并加载到工作流中。我见过有类似问题的人。不幸的是,这些问题都与 cytoscape/rcy3 或 R 无关,我无法从现有答案中解决。

edge_df 数据框如下所示-

感谢您的帮助。

真诚地, 拉赫曼

【问题讨论】:

    标签: r libcurl cytoscape.js


    【解决方案1】:

    这是 RCy3 项目的一个已知错误,已在本月底发布的下一个 Bioconductor 版本中修复。您可以同时安装开发版本。 https://github.com/cytoscape/RCy3

    【讨论】:

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