R CMD 氧气无法识别答案

【问题标题】：R CMD roxygen not recognizedR CMD 氧气无法识别
【发布时间】：2011-05-22 07:17:45
【问题描述】：

我刚刚试用了 Roxygen 包。在 R 中，我可以运行 Roxygen Vignette 中的示例。但在命令行中，R CMD roxygen 未被识别为有效命令。当我运行R CMD --help 时，我可以看到所有INSTALL, check, ...sweave..., config... 命令项，但看不到roxygen。谁能帮我解决这个问题？除了install.packages("roxygen")，还需要其他安装步骤吗？我使用带有 R 2.12.0 和工作 Rtools 环境的 Windows 32。谢谢。

【问题讨论】：

我也在 Windows 上，但我使用的是 cygwin Bash shell。如果我运行 R CMD roxygen.sh（注意，.sh），它可以工作。但是，如果我使用 Windows 命令行，它不起作用（当然不是，它是一个 shell 脚本......）。

标签： r roxygen

【解决方案1】：

如果我记得，您必须从源代码安装包，以便它们能够为R CMD 提供额外的命令。这是因为安装新的R CMD 命令有点小技巧——它需要劫持配置脚本或 Makefile 并让它们将文件复制到 R bin 文件夹。从二进制安装一个包只是解压一个存档，configure 和 make 永远不会运行。

所以试试install.packages('roxygen', type='source')。在 Windows 上，您需要先安装 RTools，然后才能使用。

【讨论】：

谢谢。有同样的问题。以管理员身份从源代码安装。

【解决方案2】：

我前几天刚碰到这个。我以管理员身份安装并修复了它。只需以管理员身份运行 R，然后正常执行 install.packages，然后重新启动 R，因为您真的不想以管理员身份运行它。

【讨论】：

刚刚进行了全新安装，但似乎并没有奏效，抱歉，我不太确定当时我做了什么让它工作。
我在 Ubuntu 中遇到了这个问题，不得不“sudo R”然后安装包。

【解决方案3】：

这是我发现在 Windows 的命令行 (DOS) 中使用 roxygen2 很有用的解决方法。大部分资料是从here借来的。

使用内容创建文件roxy.R：

library(methods)
library(utils)
require(roxygen2)
roxygenize("myPackage")

（或您在roxygen 中使用的任何参数）。

然后用内容创建批处理文件f.bat：

Rscript roxy.R

然后从命令行运行f：

> f

注意事项：

确保Rscript.exe 在您的路径中。通常可以在 c:\r:\bin\ 之类的地方找到它

（要在 Windows 中编辑路径，请右键单击“我的电脑”，然后选择“属性”，然后选择“高级系统设置”（在左侧菜单中），然后选择“高级”选项卡，“环境变量”按钮，“系统变量” , '路径'。）

【讨论】：

【解决方案4】：

我在 Windows 上进行了测试。 R CMD %R_home%\bin\roxygen.sh 有效。但R CMD roxygen.sh 和R CMD roxygen 都不能在 DOS 命令下工作。尽管.sh 已与sh.exe 关联，并且%R_home%\bin\ 在系统路径上。使用R CMD INSTALL 或install.packages(type='source') 按源安装也是如此。

【讨论】：