从 PHP 中运行 Rscript：无法加载共享库答案

【问题标题】：Running Rscript from within PHP: cannot load shared libraries从 PHP 中运行 Rscript：无法加载共享库
【发布时间】：2018-09-18 06:38:22
【问题描述】：

我正在尝试从 PHP 中运行 R 代码。我正在使用 RHEL 7.4。

但是，由于 Apache 以不同于安装 R 包的用户身份运行，它无法加载包：

我的 PHP 代码有这一行：

echo shell_exec("(Rscript -e 'library(lme4, lib.loc = \"/var/www/R/lib\")')2>&1");

在浏览器中产生此错误：

Error: package or namespace load failed for 'lme4' in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/var/www/R/lib/Rcpp/libs/Rcpp.so':
  /var/www/R/lib/Rcpp/libs/Rcpp.so: failed to map segment from shared object: Permission denied
Execution halted

文件/var/www/R/lib/Rcpp/libs/Rcpp.so 的权限为775，所以我认为权限实际上不是问题。

我如何告诉 Apache / PHP 在哪里寻找共享库？

服务器不是面向公众的，所以我会采取任何解决方案，从正确访问共享库到授予用户 apache sudo 访问权限和 NOPASSWD 以我的用户身份运行（或类似鲁莽的事情，因为那没有'实际上不起作用...）。

谢谢！

【问题讨论】：

标签： php r apache rhel rscript

【解决方案1】：

这似乎部分是由于 Red Hat 中的 SELinux 设置。我不完全确定这是以 Red Hat 为中心，还是特定于我大学的配置（首先安装了 Red Hat）。

原来：

$ getenforce
Enforcing

修复：

$ sudo setenforce 0
$ getenforce
Permissive

持久修复：修改 /etc/selinux/config 以拥有该行

SELINUX=Permissive

感谢this StackOverflow 线程。

【讨论】：