使用 rpy2 和 ggplot2 制作图表答案

【问题标题】：Using rpy2 with ggplot2 to make graphs使用 rpy2 和 ggplot2 制作图表
【发布时间】：2013-06-10 23:40:14
【问题描述】：

我正在尝试使用 rpy2 在我的 python 管道中集成一些图形生成。在 R 内部生成的相同 PDF 显然在 rpy2 内部不起作用。这个简单的脚本将生成一个可读的 PDF 文件：

#!/usr/bin/env R
library(ggplot2)
library(datasets)
p = ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) + xlab('Weight (lb/1000)') + ylab('Miles/(US) gallon')
pdf(file='mtcars.pdf')
p + geom_point(aes(colour=factor(cyl)))
dev.off()

虽然等效的 python 代码会生成一个 4 KB 的文件，但任何 PDF 阅读器都无法读取：

#!/usr/bin/env python
from rpy2 import robjects as ro
ro.r("library(ggplot2)")
ro.r("library(datasets)")
ro.r("p = ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) + xlab('Weight (lb/1000)') + ylab('Miles/(US) gallon')")
ro.r("pdf(file='mtcars.pdf')")
ro.r("p + geom_point(aes(colour=factor(cyl)))")
ro.r("dev.off()")

我正在使用：

* Python 2.7.3
* R 2.15.2
* rpy2 2.3.6
* ggplot2 0.9.3.1

任何想法为什么会发生这种情况？非常感谢您的帮助。

【问题讨论】：

标签： python r ggplot2 rpy2

【解决方案1】：

任何想法为什么会发生这种情况？非常感谢您的帮助。

永远不会绘制 ggplot 图形。在交互式 R 中，将某些内容返回到控制台将 print() 它（对于 ggplot 对象，它们会被绘制）。您必须明确致电print()。

您可能还想查看rpy2 documentation for ggplot2。

【讨论】：