用rpy2映射python元组和R列表？答案

【问题标题】：Mapping python tuple and R list with rpy2?用rpy2映射python元组和R列表？
【发布时间】：2011-03-19 01:23:50
【问题描述】：

我在理解与 rpy2 对象和 python 对象的映射时遇到了一些麻烦。

我有一个函数（x），它在 python 中返回一个元组对象，我想用 R 对象列表或向量映射这个元组对象。

首先，我正在尝试这样做：

# return a python tuple into this r object tlist
robjects.r.tlist = get_max_ticks(x) 

#Convert list into dataframe
r('x <- as.data.frame(tlist,row.names=c("seed","ticks"))')

失败并出现错误： rinterface.RRuntimeError：eval（expr，envir，enclos）中的错误：找不到对象'tlist'

所以我正在尝试另一种策略：

robjects.r["tlist"]  = get_max_ticks(x)
r('x <- as.data.frame(tlist,row.names=c("seed","ticks"))')

失败并出现此错误： TypeError: 'R' 对象不支持项目分配

你能帮我理解吗？非常感谢！！

【问题讨论】：

标签： python r mapping tuples rpy2

【解决方案1】：

使用globalEnv:

import rpy2.robjects as ro
r=ro.r

def get_max_ticks():
    return (1,2)
ro.globalEnv['tlist'] = ro.FloatVector(get_max_ticks())
r('x <- as.data.frame(tlist,row.names=c("seed","ticks"))')
print(r['x'])
#       tlist
# seed      1
# ticks     2

可以使用robjects.r.tlist 这种类型的符号访问R 命名空间中的符号，但您不能以这种方式分配值。分配符号的方法是使用robject.globalEnv。

此外，R 中的某些符号可能包含句点，例如data.frame。您不能使用类似于robjects.r.data.frame 的符号在Python 中访问此类符号，因为Python 对句点的解释不同于R。所以我建议完全避免这种表示法，而是使用 robjects.r['data.frame']，因为无论符号名称是什么，这个符号都有效。

【讨论】：

这种表示法也不安全，因为之前在某处执行类似 "ro.globalEnv['data.frame'] = ro.r('function(x) NULL')" 的操作会导致问题。我建议使用 DataFrame 类。
感谢 @~unutbu，感谢 @lgautier 在这里和邮件列表中的回复，现在我正在尝试理解手册中 data.frame 对象的示例

【解决方案2】：

你也可以一起避免 R 中的赋值：

import rpy2.robjects as ro
tlist = ro.FloatVector((1,2))
keyWordArgs = {'row.names':ro.StrVector(("seed","ticks"))}
x = ro.r['as.data.frame'](tlist,**keyWordArgs)
ro.r['print'](x)

【讨论】：