由于“未定义对‘libiconv’的引用”，R 的安装失败答案

【问题标题】：Installation of R fails because of "undefined reference to `libiconv'"由于“未定义对‘libiconv’的引用”，R 的安装失败
【发布时间】：2019-05-05 17:11:56
【问题描述】：

我在安装 R 3.5.1 时遇到问题。虽然我在“cshrc”中定义了库“libiconv”的路径，但安装失败并显示以下消息：

-L"../../lib" -lRblas -L/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.4 -lgfortran -lm   -lreadline  -lpcre -llzma -lbz2 -lz -lrt -ldl -lm
platform.o: In function `do_eSoftVersion':
/opt/local/rstudio/R-3.5.1/src/main/platform.c:3088: undefined reference to `_libiconv_version'
sysutils.o: In function `Riconv':
/opt/local/rstudio/R-3.5.1/src/main/sysutils.c:799: undefined reference to `libiconv'
/opt/local/rstudio/R-3.5.1/src/main/sysutils.c:799: undefined reference to `libiconv'
/opt/local/rstudio/R-3.5.1/src/main/sysutils.c:799: undefined reference to `libiconv'
/opt/local/rstudio/R-3.5.1/src/main/sysutils.c:799: undefined reference to `libiconv'
sysutils.o: In function `Riconv_close':
 ...

顺便说一句，我没有root权限。

经过2天的搜索，我找不到原因。

任何帮助将不胜感激。

【问题讨论】：

标签： r centos iconv libiconv

【解决方案1】：

您似乎正在使用 glibc 系统（见证：一个针对 x86_64-redhat-linux 的编译器，以及您设置的标签 centos）。

在 glibc 系统上，您不需要 GNU libiconv，因为 glibc 已经包含一个功能齐全的 iconv 工具。所以只需卸载 libiconv，然后从头开始重建 R (make distclean;configure;make)。

【讨论】：

感谢您的建议。我可以通过使用 conda 重新安装 R 来解决我的问题。我将其添加为帮助其他面临相同问题的人的答案。

【解决方案2】：

我可以通过使用 conda 重新安装 R 来解决这个问题。不仅是 R，其他需要的库和 rstudio 都可以通过 conda 轻松安装。例如 R、rstudio 和 plotly（一个库）通过以下命令安装：

conda install -c r r-essentials —-prefix=/where/to/install
conda install -c r rstudio  —-prefix=/where/to/install
conda install -c conda-forge r-plotly —-prefix=/where/to/install

享受吧。

【讨论】：

【解决方案3】：

我通过编辑 $PATH 搞清楚了，make 被 conda 误导了。

echo $PATH
:/gatk:/opt/miniconda/envs/gatk/bin:/opt/miniconda/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin

PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/gatk:/opt/miniconda/envs/gatk/bin:/opt/miniconda/bin:
export PATH

【讨论】：

【解决方案4】：

我有同样的错误。从您的综合答案中，我认为是康达。修复：

conda deactivate
make distclean、configure 和 make

【讨论】：