将 Python 列表转换为 R 数值向量答案

【问题标题】：converting a Python list to an R numeric vector将 Python 列表转换为 R 数值向量
【发布时间】：2012-07-17 12:21:50
【问题描述】：

我需要将我的数据放入 Beta 分布并检索 alpha 参数。

我一直在用 Python 编写代码，但在 SciPy 中似乎没有任何 beta 拟合函数。要么我在我不太熟悉的 Matlab 中做所有事情，要么在 Python 中使用 R 及其fitdistr 函数。所以我选择了后者。

from rpy2.robjects.packages import importr

MASS = importr('MASS')

然后我在 [0,1) 范围内获取浮点数的 numpy 向量，并将其传递给 fitdistr:

myVector = myVector.tolist()
MASS.fitdistr(myVector,"beta")

太糟糕了，它需要某种其他向量。 rpy 和 rpy2 不是应该为我做所有的转换吗？

Error in function (x, densfun, start, ...)  : 
  'x' must be a non-empty numeric vector
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/functions.py", line 82, in __call__
    return super(SignatureTranslatedFunction, self).__call__(*args, **kwargs)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/functions.py", line 34, in __call__
    res = super(Function, self).__call__(*new_args, **new_kwargs)
rpy2.rinterface.RRuntimeError: Error in function (x, densfun, start, ...)  : 
  'x' must be a non-empty numeric vector

我需要在这里做什么？

【问题讨论】：

标签： python r vector rpy2

【解决方案1】：

答案在这里： Converting python objects for rpy2

import rpy2.robjects.numpy2ri
rpy2.robjects.numpy2ri.activate()

见http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc/html/numpy.html:

【讨论】：