如何使用默认 R 安装通过 conda 安装 rpy2答案

【问题标题】：How to install rpy2 via conda using default R installation如何使用默认 R 安装通过 conda 安装 rpy2
【发布时间】：2015-10-02 05:47:02
【问题描述】：

我在 Ubuntu linux 上使用 Anaconda Python 发行版，并希望在 IPython 笔记本中使用 R 魔法。有没有办法使用 conda 发行版安装 rpy2 并在 /usr/bin/R 使用我当前的默认 R 安装？我的目标是保持当前的 R 安装不变，而不通过 conda 安装 R 或其他 R 包。

response to a related question 建议在 mac 上使用配方，但对我不起作用：

conda skeleton pypi rpy2
conda build rpy2
conda install rpy2 --use-local

构建命令产生以下错误：

Error: No packages found in current linux-64 channels matching:  singledispatch

我可以通过 binstar 安装 singledispatch：

conda install -c https://conda.binstar.org/asmeurer singledispatch

conda list | grep "singledispatch"
singledispatch            3.4.0.3                  py27_1

但是我得到了同样的错误，在当前的 linux-64 频道中找不到包。

【问题讨论】：

conda 可能存在故障。您可能想在他们的跟踪器上报告它。否则，只有在运行 python 2.7 时才需要 singledispatch，因为它在带有 Python 3.4 的 functools 中可用。如果坚持使用 Python 2.7，pip install singledispatch 应该会让你继续前进。

标签： linux r python-2.7 anaconda rpy2

【解决方案1】：

我遇到了类似的问题，软件包没有安装在正确的位置，我建议改用 apt 而不是 conda

sudo apt install python-rpy2

编辑： * 注意 rpy2 的官方支持已停止 2.7 *

【讨论】：