Rmarkdown knit 错误：生成代码中的错误/访问冲突答案

【问题标题】：Rmarkdown knit error: Fault/access violation in generated codeRmarkdown knit 错误：生成代码中的错误/访问冲突
【发布时间】：2018-07-19 07:24:25
【问题描述】：

我的环境中有一个特定的错误，导致我无法始终如一地将 Rmarkdown 文件编入 HTML、Word 文档或 PDF。编织能力因文件类型而异。

HTML - 有时会编织
Word 文档 - 有时会编织
PDF - 从不编织。总是抛出同样的错误

错误是：

Segmentation fault/access violation in generated code
Error: pandoc document conversion failed with error 1

直到一周前，我还能够在同一个环境中编织所有三种文件类型，所以这是一个相对较新的错误。我的环境的高级规范是：

操作系统：Windows 10
R：3.4.3
RStudio：1.1.419
针织机：1.19
降价：1.8
pandoc：1.19.2.1
MiKTeX：2.9

作为编织能力不一致的示例，我在 RStudio 中创建了一个新的 .Rmd 文件，该文件创建了熟悉的标准模板 summary(cars) 和 plot(pressure) 等。我没有对其进行任何更改。我能够成功地将它编织到 HTML 一次，Word .docx 一次，然后我尝试编织到 PDF 并得到上面的错误。然后我返回并尝试编织到 HTML 和 Word 并收到错误，即使原始编织没有任何变化。这只是行为类型的一个示例。不同的文档表现不同。

为了进行故障排除，我重新安装了 R 和 RStudio（我相信 pandoc 提供了 RStudio 安装，所以我也有效地重新安装了 pandoc）。重新安装没有帮助。我试过清除 Knitr 缓存。那也没有用。我浏览了 SO 和互联网，发现了一些与 Glasgow-Haskell 编译器相关的类似错误，但我不知道那是什么以及它是否是问题的根源。

以下是引发错误的 .Rmd 文件示例：

---
title: "Untitled"
author: "Vypa"
date: "February 8, 2018"
output:
  html_document: default
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

## R Markdown

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.

When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:

```{r cars}
summary(cars)
```

## Including Plots

You can also embed plots, for example:

```{r pressure, echo=FALSE}
plot(pressure)
```

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

这是完整的控制台错误：

Segmentation fault/access violation in generated code
Error: pandoc document conversion failed with error 1
In addition: Warning message:
running command '"C:/Users/Vypa/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS tst.utf8.md --to html --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash --output tst.html --smart --email-obfuscation none --self-contained --standalone --section-divs --template "C:\Users\Vypa\Documents\R\R-3.4.3\library\rmarkdown\rmd\h\default.html" --no-highlight --variable highlightjs=1 --variable "theme:bootstrap" --include-in-header "C:\Users\Vypa\AppData\Local\Temp\RtmpI9Gxsx\rmarkdown-str5db029544a23.html" --mathjax --variable "mathjax-url:https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"' had status 1 
Execution halted

任何帮助或想法将不胜感激。

【问题讨论】：

pandoc 也是最新的吗？
如果你写一个 .Rmd 文件的例子会有所帮助
嗨 EuGENE - 我想是的，因为 pandoc 是随 RStudio 一起安装的，而且我有最新的稳定版 RStudio。但是，我无法在我的 RStudio 安装中找到确切的 pandoc 版本。
@romles 我认为函数是rmarkdown::pandoc_version() 来获取版本。 pandoc_available() 只是为我返回一个布尔值。我已经编辑了我的帖子以显示 pandoc 的版本，所以感谢您指出我的方向。
@romles 感谢您的帮助。我说得太早了。从 github 安装 rmarkdown 然后重新启动 R 和 RStudio，我现在可以编织所有三种文档类型。如果您想回复此问题，我会将您的答案标记为正确。

标签： rstudio r-markdown pandoc

【解决方案1】：

更新 pandoc 为我解决了这个问题。

https://pandoc.org/installing.html

感谢@EuGENE。为了清楚起见，在此处添加答案。

【讨论】：

【解决方案2】：

最近在 Win10 上安装 R&RStudio 后遇到了同样的问题。 Pandoc 问题出现在以前没有错误的 .rmd 文件的编辑和 knitr 上。

在安装 RStudio 的最新预览版后解决

https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/preview/

【讨论】：