如何在 R 包构建中压缩保存答案

【问题标题】：How to compress saves in R package build如何在 R 包构建中压缩保存
【发布时间】：2015-12-12 20:44:45
【问题描述】：

我正在尝试在 R 包中包含一个（有点）大的数据集。在检查 Rstudio 时，我不断收到警告，说我可以通过压缩来节省空间：

* checking data for ASCII and uncompressed saves ... WARNING

  Note: significantly better compression could be obtained
        by using R CMD build --resave-data
          old_size new_size compress
  slp.rda    499Kb    310Kb    bzip2
  sst.rda    1.3Mb    977Kb       xz

我已尝试将-- resave-data 添加到 RStudio 的“配置构建工具”中，但没有效果。

【问题讨论】：

标签： r rstudio devtools roxygen2

【解决方案1】：

devtools 函数use_data 采用压缩类型的参数，通常使向 pkgs 添加数据更容易。使用它，或者只使用save），在保存数据时使用xz 压缩（对于save，它是compression_level 参数）。

如果您想使用--resave-data，那么您可以尝试--resave-data=best，因为仅使用--resave-data 默认为gzip（在这种情况下几乎没有任何好处）。

更多信息请参见Building package tarballs。

【讨论】：

感谢您的回答 - 我已尝试使用压缩 save。压缩错误现在消失了，但现在我收到警告：Warning: package needs dependence on R (>= 2.10)。有这方面的经验吗？
这是由于额外的压缩。将R (>= 2.10) 添加到您的DESCRIPTION 文件中。

【解决方案2】：

如果您不想重新创建大型数据集，则另一种选择是在 R 中使用 tools::resaveRdaFiles。将其指向数据集文件或整个数据目录，它将压缩您选择的格式的数据。请参阅其manual page 了解更多信息。

【讨论】：