编织到 PDF 时缺少嵌入图

Question

我知道有人以不同的格式提出过这个问题，但是在搜索时我找不到与我类似的解决方案或问题。 使用 Mac 和 RStudio（版本 1.0.153）R（版本 3.4.3 (2017-11-30) -- "Kite-Eating Tree"）

我只是想在 R markdown 中编织一个 PDF（使用 knitr 编织），但是当我这样做时，这些图就丢失了。当我编织成 HTML 时，情节就在那里。我正在使用有助于创建绘图的 earlywarnings 包。请参阅下面使用 R 降价的示例：

```{r, earlywarnings, fig.keep='all'}
library(earlywarnings)
data("foldbif")
x = foldbif
plot.ts(x)
```

该图显示在 pdf 输出中，但在我创建其他类似的图时却没有：

```{r, echo=FALSE,results='hide',fig.keep='all', fig=TRUE}
out<-generic_ews(x,winsize=50,detrending="gaussian",
bandwidth=5,logtransform=FALSE,interpolate=FALSE)
```

或者这个：

```{r, echo=FALSE, results='hide', fig.keep='all', fig=TRUE, warning=FALSE}
qda = qda_ews(x, param = NULL, winsize = 50, detrending = "gaussian",
bandwidth = NULL, boots = 100,s_level = 0.05, cutoff = 0.05,
detection.threshold = 0.002, grid.size = 50, logtransform = FALSE, interpolate = FALSE)
```

最后一个函数也只显示 3 个绘图中的 2 个，但我会在另一次解决这个问题。

任何帮助将不胜感激。如果不清楚，请告诉我。

Answer 1

我可以确认该问题与dev.new() 的使用有关。我复制粘贴了函数的代码，将其删除（函数的第 136 行）并且它起作用了，即我在我的 pdf 中得到了这个数字。可能有一种方法可以调用函数来避免我不知道的dev.new() 的影响。