从 Linux 上的 RStudio 中建立 ssh 连接

Question

我正在尝试将文件从另一台计算机拉到 Centos 6 上 RStudio 的 R 环境中

我首先在纯 R 中尝试过，当我发布时

readLines(pipe( 'ssh root@X.X.X.X "cat /path/somefile.sh"' ))

它正确地询问我 ssh 密钥的密码并读取内容。

但是，如果从 RStudio 执行相同的命令，我得到的只是：

ssh_askpass: exec(rpostback-askpass): No such file or directory
Permission denied, please try again.
ssh_askpass: exec(rpostback-askpass): No such file or directory
Permission denied, please try again.
ssh_askpass: exec(rpostback-askpass): No such file or dire
Permission denied (publickey,gssapi-with-mic,password).

我怀疑原因是因为 centos 上的 rstudio 实际上使用 rstudio-server 用户（并且 gui 是在浏览器中提供的）。有谁知道如何从中正确访问 ssh 资源？

UPD：执行后

Sys.setenv(PATH = paste0(Sys.getenv('PATH'), ':/usr/lib/rstudio-server/bin/postback'))

按照下面的建议，它不会输出 askpass 错误，但它仍然不起作用。现在好像控制台在无限期地等待命令执行

Answer 1

rpostback-askpass 是 RStudio 的一部分。将其位置（我的系统上的/usr/lib/rstudio-server/bin/postback）添加到PATH 可能会有所帮助，以便 ssh 可以找到它：

Sys.setenv(PATH = paste0(Sys.getenv('PATH'), ':/usr/lib/rstudio-server/bin/postback'))

更新 RCurl 具有scp 用于通过 ssh 连接复制文件的功能。有关详细信息，请参阅this answer。如果您使用 RStudio 运行脚本，则可以使用其 API 以交互方式输入 ssh 密码，并隐藏输入：

pass <- .rs.askForPassword("password?")

rstudioapi 可以帮助判断脚本是否由 RStudio 启动。