【发布时间】:2017-05-09 23:27:43
【问题描述】:
我正在使用deckjs 框架在slidfy 中进行演示。 一切正常,但突然出现这段代码:
ggplot(cars, aes(x = speed, y = dist)) + geom_point(color = 'red') + stat_smooth(method = "lm", formula = y ~ x, size = 0.5, se = F)
停止工作并显示此错误:
## Error: ScalesList was built with an incompatible version of ggproto.
## Please reinstall the package that provides this extension.
当从源代码或控制台执行时,代码可以完美运行...但是从 R 降价中它不再有效。失败的函数是 stat_smooth()。如果没有平滑执行,其余的可视化都可以。
Here 和here 报了类似的错误,提供的解决方案是从github重新安装ggplot和包,但是我不确定我应该安装哪些包,此外,代码只会失败来自 Rmarkdown,而不是从控制台或源代码执行时。
谢谢
【问题讨论】:
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干净地启动 R(必要时在香草模式下)。运行现有代码(生成错误)。运行
sessionInfo()。请参阅 pkg 列表。重新安装/升级这些软件包。再试一次。请注意,您应该先安装 ggplot2,然后再安装任何包含 ggplot2 geoms/scales/etc 的 pkg。 -
你是如何编织 rmd 的? RStudio 中的 knit cmd 还是通过函数调用?
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knit 和 "script" 文档的包加载顺序有何不同?
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您可以
knitr::purl()您的文档,然后运行它生成的 R 源代码,看看它在哪里阻塞。 -
在每个环境中打印出
.libPaths()的结果。我猜它们会有所不同,并且错误消息告诉您 htere 是其中一个库目录上的过时版本。