加载 rJava 包时的 java 路径错误

Question

我正在尝试在我的 Unix 机器中加载“rJava”包。 在加载之前，我已经使用

设置了路径

Sys.setenv("JAVA_HOME= myfilepath") 

在我的 R 脚本中。

尽管如此，我收到以下错误（以下是错误的一部分）：

checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/lib/jvm/jre/bin/java'
archiver    : '/usr/lib/jvm/jre/../bin/jar'
compiler    : '/usr/lib/jvm/jre/../bin/javac'
header prep.: '/usr/lib/jvm/jre/../bin/javah'
cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java/include I/usr/lib/jvm/java/include/linux'
java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-1.6.0-openjdk-1.6.0.0.x86_64/jre/lib/amd64/server -ljvm'
checking whether Java run-time works... ./configure: line 3729: /usr/lib/jvm/jre/bin/java: No such file or directory
no configure: error: Java interpreter '/usr/lib/jvm/jre/bin/java' does not work

如您所见，错误显示 /usr/lib/jvm/jre/bin/java: No such file or directory。 但我没有将它设置为 myfilepath。 如何防止安装程序查看此路径？

请帮忙。

Answer 1

sudo R CMD javareconf

这非常有效。如果将来有人阅读此内容，请保留此内容。

Answer 2

我在VirtualBox上有一个Ubuntu 14.04 LTS的VM，我的java-jdk的真实安装路径如下：

/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64

这个命令非常适合我的情况。 我在 RStudio 上安装或 rJava 包时遇到了这种类型的错误：

*./configure: line 3736: /usr/lib/jvm/default-java/jre/bin/java: No such file or directory*

首先，我以这种方式修改了配置文件： sudo gedit /etc/profile 然后在 eof 中添加此说明：

JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64
PATH=$PATH:$HOME/bin:$JAVA_HOME/bin
export JAVA_HOME
export PATH

在此之后，我在终端会话中输入了命令：

sudo R CMD javareconf

并且成功安装了rJava包。

注意：在运行sudo R CMD javareconf 之前，您可能还需要设置LD_LIBRARY_PATH environment variable。

Answer 3

在 Ubuntu 14.04 中遇到同样的问题。经过简单的安装后，此安装指南对我很有帮助。 http://www.korecky.org/?p=1254（安装 R）和 [http://www.korecky.org/?p=847]（安装Java）