【发布时间】：2012-11-16 14:41:42
【问题描述】：
有没有人设法让 rJava 0.9-3 在 OS X 10.7.4 和 Oracle Java 1.7 上工作？
R version 2.15.2 (2012-10-26) -- "Trick or Treat" Platform
x86_64-apple-darwin9.8.0/x86_64 (64-bit)
java version "1.7.0_09"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_09-b05)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 23.5-b02, mixed mode)
我已经使用 install.packages 函数和命令行安装 R 2.15.2 安装了 rJava。我没有收到任何错误。
$ R CMD INSTALL rJava
* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library’
* installing *binary* package ‘rJava’ ...
* DONE (rJava)
$
如果我使用 Java Preferences 将 1.7 放在列表的首位，但将 1.6 保留为“开启”，rJava 总是从 1.6 开始。
如果我使用 Java Preferences 将 1.7 放在首位并关闭 1.6，rJava 会这样做：
> library(rJava)
> .jinit()
JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at "" instead.
JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver.dylib
JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library.
Error in .jinit() : JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1
>
但是，使用 system 函数，R 自己会找到 Java 1.7。
> system("java -version")
java version "1.7.0_09"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_09-b05)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 23.5-b02, mixed mode)
>
1.7 是否需要在 /System/Library/Java/JavaConfig.plist 中添加特殊条目？
版本目录是否需要针对 1.7 进行调整？奇怪的是，Current 转到 A，最终以 1.7 结束，而 CurrentJDK 映射到 1.6
$cd /System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Versions/
$ls -la
total 64
drwxr-xr-x 11 root wheel 374 Sep 26 10:10 .
drwxr-xr-x 11 root wheel 374 Nov 26 09:24 ..
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.4 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.4.2 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.5 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.5.0 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.6 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.6.0 -> CurrentJDK
drwxr-xr-x 8 root wheel 272 Nov 26 09:24 A
lrwxr-xr-x 1 root wheel 1 Sep 26 10:09 Current -> A
lrwxr-xr-x 1 root wheel 59 Sep 26 10:09 CurrentJDK -> /System/Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents
即使使用 R CMD javareconf 运行路径直接指向 1.7 文件或 /usr/bin/java 路径，rJava 仍然无法找到或启动 Java 1.7。
1.7 需要设置 JAVA_LD_LIBRARY_PATH 变量吗？
Makeconf:JAVA = /usr/bin/java
Makeconf:JAVAC = /usr/bin/javac
Makeconf:JAVAH = /usr/bin/javah
Makeconf:JAVA_HOME = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre
Makeconf:JAVA_LD_LIBRARY_PATH =
Makeconf:JAVA_LIBS = -framework JavaVM
Makeconf:JAVA_CPPFLAGS = -I$(JAVA_HOME)/include
Makeconf:JAR = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/bin/jar
Makeconf:JAVA = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre/bin/java
Makeconf:JAVAC = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/bin/javac
Makeconf:JAVAH = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/bin/javah
Makeconf:JAVA_HOME = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre
Makeconf:JAVA_LD_LIBRARY_PATH =
Makeconf:JAVA_LIBS = -framework JavaVM
Makeconf:JAVA_CPPFLAGS = -I$(JAVA_HOME)/include
感谢您的帮助
更新 1：
我在 stats-rosuda-devel 列表中提出了这个问题，并收到了 Simon Urbanek 的以下回复。我不认为 Windows 和 Linux 在需要从源代码编译 Java 1.7 方面存在相同的问题，因为我们在 Windows 和 Linux 上运行它并且不必编译 rJava。一旦我有机会尝试这个，我会回来报告：
您正在使用针对系统 Java 编译的 二进制文件 （在您的系统上是 1.6）-因此，如果您删除 Java 1.6，您将中断 它。如果你想使用 Java 1.7，你必须重新配置 R Java 1.7 并重新编译 rJava 以使用这些设置。注意 Oracle 的 Java 生活在一个完全不同的地方 (/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk) 比系统 Java（/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework），所以不是 可以互换。
另外，Oracle Java 1.7 不是一个框架，它是一团糟 并不是真正为 OS X 设计的，所以你必须手动设置它 像在 Linux 上的设置 - 这非常痛苦。它还需要 覆盖......所以如果你真的想进入兔子洞，这个 对我有用：
JAVA_LD_LIBRARY_PATH=/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre/lib/server JAVA_LIBS='-L/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre/lib/server -ljvm' JAVA_CPPFLAGS='-I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/include -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/include/darwin' R64 CMD javareconf然后从源代码安装 rJava (R64 -> install.packages("rJava",type='source'))。请注意，它只有 64 位， 所以它只适用于 64 位 R。
【问题讨论】：
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我在这里没有任何特别的见解，但您可能想从源代码安装 rJava，或尝试 stats-rosuda-devel 邮件列表。
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我确实在名单上问过了，刚刚收到了答复。我会将其添加到上面的原始问题中。
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感谢您用西蒙的回答更新。如果不是横向滚动的代码格式，阅读起来会更容易。
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@java_xof - 你把它弄反了 - Linux 是这个混乱的来源 - 我们必须跳过很多圈才能让 Linux 标志工作。在 Mac 上，事物都是框架，因此根本不需要复杂的标志。但是，Oracle 只是将 Linux 设置安装到 OS X 上，这就是它如此损坏的原因。 Oracle 现在基本上需要在 OS X 上进行 Linux 修复，而在需要的地方没有修复，这就是它不起作用的原因。
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@SimonUrbanek - 别生气，冷静，节奏不是战争；对于我和我的同事，我们尽量避免在 Linux 上运行任何 Java 应用程序，但是我们编写了一些在 MS Win 和 Linux 上都可以运行的小型 Java 应用程序，但 MAC OS 总是存在问题；也就是说，如果我们选择商业操作系统，我们会选择 linux（也许在少数台式机上会胜出），仅此而已 - 请记住，我从未使用过 MAC 操作系统……为所有操作系统欢呼和步伐！