【问题标题】：How do I change the default library path for R packages如何更改 R 包的默认库路径
【发布时间】：2015-10-20 21:01:47
【问题描述】：

我试图在我的工作计算机上的本地驱动器上安装 R 和 R studio，而不是在组织网络文件夹上，因为通过网络运行的任何东西都非常慢。安装时，目标路径显示它是我的本地 C:drive。但是，当我安装新软件包时，显示的默认路径是我的网络驱动器，并且没有选项可以更改：

.libPaths()
[1] "\\\\The library/path/I/don't/want"
[2] "C:/Program Files/R/R-3.2.1/library"

我正在运行 Windows 7 专业版。如何删除库路径 [1] 并使路径 [2] 成为所有基本包和我安装的所有新包的主要路径？

【问题讨论】：

标签： r

【解决方案1】：

请参阅help(Startup) 和help(.libPaths)，因为您有几种可能已经设置好了。其中有

设置R_LIBS_USER
在.Rprofile 或Rprofile.site 中分配.libPaths()

等等。

在这种特殊情况下，您需要返回并取消设置 \\\\The library/path/I/don't/want 的设置。

若要忽略它，您需要显式覆盖它，即通过

library("somePackage", lib.loc=.libPaths()[-1])

加载包时。

【讨论】：

非常感谢，我刚刚设置了 .libPaths("C:/Program Files/R/R-3.2.1/library") 现在这是显示的唯一路径。
有趣。我认为这添加而不是覆盖？
它肯定会添加到我的 Unix 机器上现有的 .libPaths()。
在帮助文件中似乎表明使用该命令设置库路径。类似于设置工作目录。我可能是错的，但这似乎是它对我的作用。第一个网络路径不再出现。问题是在安装基本包时，我必须在网络之外进行，否则默认情况下它会将程序保存在我的 C:Drive 上以及我们网络上的副本。我无法阻止将基础库保存在网络上，只能阻止我安装的任何其他软件包。
@DirkEddelbuettel 我相信这个功能不会添加到现有的.libPaths()。它采用指定的路径（或向量），如果不包含系统库路径，则附加它，然后设置。之前可能添加的任何其他路径，包括初始化过程中特定于用户的内容，都需要使用 .libPaths(c(mydir1,mydir2,.libPaths())) 或类似的方式显式保留。

【解决方案2】：

Windows 7/10：如果您的 C:\Program Files（或安装了 R 的任何位置）被阻止写入，就像我的一样，那么您将在编辑 RProfile.site 时感到沮丧（就像我所做的那样）。如上所述，我更新了R_LIBS_USER 并且它起作用了。然而，即使在多次阅读精美手册和广泛搜索之后，我也花了几个小时才完成这项工作。本着为别人节省时间的精神......

假设您希望您的包驻留在C:\R\Library：

创建文件夹C:\R\Library
点击Start --> Control Panel --> User Accounts --> Change my environmental variables
Environmental Variables 窗口弹出。如果您看到R_LIBS_USER，请突出显示它并单击Edit。否则单击New。这两个操作都会打开一个窗口，其中包含 Variable 和 Value 的字段。
在我的例子中，R_LIBS_USER 已经存在，并且值是我桌面的路径。我将创建的文件夹添加到路径中，如上所述用分号分隔。 C:\R\Library;C:\Users\Eric.Krantz\Desktop\R stuff\Packages。注意：我本可以删除桌面位置的路径，然后直接离开 C:\R\Library。

【讨论】：

感谢您一步一步的操作，似乎在 Windows 10 中也适用于我。
这对我有用，但我在某些包（tidyverse、sf、AER 到目前为止）中遇到错误：“程序入口点 EXTPTR_PTR 无法位于动态链接库中。”任何人明白了吗？
@winitheju ：请参阅github.com/r-lib/rlang/issues/416sandJohnson 的说明

【解决方案3】：

面对同样的问题（避免网络中的默认路径），我根据其他答案中给出的提示提出了这个解决方案。

解决方案是编辑Rprofile 文件以覆盖默认指向主目录的变量R_LIBS_USER。

步骤如下：

为库创建目标目标文件夹，例如， ~\target。
找到Rprofile 文件。就我而言，它位于C:\Program Files\R\R-3.3.3\library\base\R\Rprofile。
编辑文件并更改变量R_LIBS_USER 的定义。就我而言，我将这一行 file.path(Sys.getenv("R_USER"), "R", 替换为 file.path("~\target", "R",。

支持这个解决方案的文档是here

原始文件：

 if(!nzchar(Sys.getenv("R_LIBS_USER")))
     Sys.setenv(R_LIBS_USER=
                file.path(Sys.getenv("R_USER"), "R",
                          "win-library",
                          paste(R.version$major,
                                sub("\\..*$", "", R.version$minor),
                                sep=".")
                          ))

修改文件：

if(!nzchar(Sys.getenv("R_LIBS_USER")))
     Sys.setenv(R_LIBS_USER=
                file.path("~\target", "R",
                          "win-library",
                          paste(R.version$major,
                                sub("\\..*$", "", R.version$minor),
                                sep=".")
                          ))

【讨论】：

我最近在一台装有 Win 7 的机器上使用了该程序，但“~\target”不起作用，我不得不使用“~/target”。我从来没有正确理解为什么以及何时使用“/”或“\”很重要。

【解决方案4】：

网络上的 Windows 10

将包存储在网络驱动器上会显着降低 R / R Studio 的性能，并且由于必须检索和推送数据的瓶颈，您需要花费大量时间等待库加载/安装通过服务器返回到本地主机。有关如何在本地计算机上创建 .RProfile 的说明，请参阅以下内容：

创建一个名为 C:\Users\xxxxxx\Documents\R\3.4 的目录（或您使用的任何 R 版本，以及您将存储本地 R 包的位置 - 您的目录位置可能与我的不同）
在 R 控制台上，键入 Sys.getenv("HOME") 以获取您的主目录（这是您的 .RProfile 将存储的位置，R 将始终在那里检查包 - 如果包存储在那里，则在网络上）
创建一个名为 .Rprofile 的文件并将其放入 :\YOUR\HOME\DIRECTORY\ON_NETWORK（在 R 控制台中输入 Sys.getenv("HOME") 后得到的目录）
.Rprofile 的文件内容应该是这样的：

#search 2 places for packages- install new packages to first directory- load built-in packages from the second (this is from your base R package- will be different for some)

.libPaths(c("C:\Users\xxxxxx\Documents\R\3.4", "C:/Program Files/Microsoft/R Client/R_SERVER/library"))

message("*** Setting libPath to local hard drive ***")

#insert a sleep command at line 12 of the unpackPkgZip function. So, just after the package is unzipped.

trace(utils:::unpackPkgZip, quote(Sys.sleep(2)), at=12L, print=TRUE)

message("*** Add 2 second delay when installing packages, to accommodate virus scanner for R 3.4 (fixed in R 3.5+)***")

# fix problem with tcltk for sqldf package: https://github.com/ggrothendieck/sqldf#problem-involvling-tcltk

options(gsubfn.engine = "R")

message("*** Successfully loaded .Rprofile ***")

重新启动 R Studio 并确认您看到上面的消息已显示。

现在您可以在本地主机上享受更快的应用程序性能，而不是在网络上存储包并减慢一切速度。

【讨论】：

另外，如果您在加载软件包时遇到问题，您可能需要进一步增加时间以适应 R 3.4 的病毒扫描程序（已在 R 3.5+ 中修复）：trace(utils:::unpackPkgZip, quote(Sys.sleep(20)), at=12L, print=TRUE)message("*** Add 20 second delay when installing packages, to accommodate virus scanner for R 3.4 (fixed in R 3.5+)***")跨度>

【解决方案5】：

我为此苦苦挣扎了一段时间，因为我的工作计算机（使用 Windows 10）在网络驱动器上创建了默认用户库，这会使 R 和 RStudio 减慢到无法使用的状态。

如果这对某人有帮助，这是我找到的最简单的方法，不需要管理员权限：

确保要安装软件包的目录存在。如果您想遵守约定，请使用：C:\Users\username\R\win-library\rversion（例如：C:\Users\janebloggs\R\win-library\3.6）
在您的主目录（可能在网络驱动器上？）中创建一个.Renviron 文件，并在其中编写一行将R_LIBS_USER 变量定义为您的自定义路径：

R_LIBS_USER=C:\Users\janebloggs\R\win-library\3.6

（也可以随意添加cmets，以#开头的行）

如果存在.Renviron 文件，R 将在启动时读取它并使用其中定义的变量，然后再运行.Rprofile 中的代码。你可以在help(Startup)阅读它。

现在它应该在会话之间保持不变！

【讨论】：

这是在几台不同的计算机（我自己的和工作的）上对我有用的唯一解决方案 - 这也可以是选定的答案吗？
@ChrisP ：不可能有几个“打勾”的答案，不，尽管提出问题的人可以改变主意。当前选择的答案确实（模糊地）涵盖了我的答案，提到 R_LIBS_USER 变量可以手动定义。遗憾的是，它没有被强调为最直接的持久解决方案。

【解决方案6】：

经过几个小时尝试以多种方式解决问题（其中一些在此处进行了描述）对我而言（在 Win 10 上）创建 Renviron 文件的选项有效，但与此处所写的内容略有不同以上。

任务是更改变量 R_LIBS_USER 的值。要做到这一点，需要两个步骤：

在文件夹 \Program\etc\ 中创建名为 Renviron 的文件（不带点）（Program 是安装 R 的目录 - 例如，对我来说它是 C:\Program Files\R\R-4.0。 0\等）
在 Renviron 中使用新路径插入一行：R_LIBS_USER = "C:/R/Library"

之后，重启 R 并使用.libPaths() 确认默认目录已更改。

【讨论】：

对我来说，问题是即使在更改文件资源管理器设置以显示隐藏文件后，我也无法在我的 PC 上创建或找到 .Renviron 文件。解决方案是使用versions 软件包安装旧版本的usethis 软件包，然后使用usethis::edit_r_environ() 通过添加以下行来编辑.Renviron 文件：R_LIBS_USER = "C:/target/directory"，其中目标目录位于您的任何位置想要将.libPaths() 映射到而不是网络驱动器。
如果您的计算机上有多个版本的 R——通常将包存储在不同的子文件夹中——修改 .Renviron 会将所有版本定向到同一个文件夹，这可能会导致与各种包的兼容性问题和他们的依赖。解决方法是为每个版本创建多个子文件夹（例如 "C:/R/Library/3.5" 和 C:/R/Library/4.0"，然后在 R_LIBS_USER 语句的末尾使用 %v：R_LIBS_USER = C:/R/Library/%v。这样，无论您打开哪个版本的 R 都会加载包来自相应的子文件夹。
@coip 两个简短的感谢和详细说明：（1）对于那些不方便使用环境文本的人，%v 可以放在字符串中的任何位置，例如 C:/R/% v/Library，虽然使用默认结构可能更好； (2) %v 也非常优雅，因为如果您将包保存到与 R 版本不同的默认目录，这可能会导致操作问题，因为根据定义，任何“基础”包都将从版本中提取R，不是您的默认值，这可能会导致操作冲突。使用 %v 可以让你的包始终保持和谐

【解决方案7】：

我想我尝试了以上所有方法，但它对我不起作用。不过，这行得通：

在主目录中，创建一个名为“.Renviron”的文件
在那个文件中，写：
```
 .libPaths(new = "/my/path/to/libs")
```
如果你打开了 R，保存并重新启动它

【讨论】：