我刚刚在http://sedodream.com/2012/08/20/WebDeployMSDeployHowToSyncAFolder.aspx 写了一篇博文来回答这个问题。从您的问题来看，您似乎对 MSDeploy 非常熟悉，因此答案可能有点冗长，但我希望对 MSDeploy 了解较少的人能够理解。我已将答案粘贴在下面。
Web Deploy（又名 MSDeploy）使用提供程序模型，并且有一个开箱即用的 good number of providers。为您提供一些提供者的示例；同步 IIS Web 应用程序时，您将使用 iisApp，对于 MSDeploy 包，您将使用包，对于 Web 服务器 webServer 等。如果要将本地文件夹同步到远程 IIS 路径，则可以使用 contentPath 提供程序.您还可以使用此提供程序将文件夹从一个网站同步到另一个网站。
在这种情况下，我们想要做的总体思路是将文件夹从您的 PC 同步到您的 IIS 网站。对 msdeploy.exe 的调用可能有点冗长，所以让我们一步一步构建命令。我们将使用下面的模板。
msdeploy.exe -verb:sync -source:contentPath="" -dest:contentPath=""
我们使用同步动词来描述我们正在尝试做的事情，然后将 contentPath 提供程序用于源和目标。现在让我们填写这些值应该是什么。对于源值，您需要传入要同步的文件夹的完整路径。在我的情况下，文件位于 C:\temp\files-to-pub。对于 dest 值，您将提供文件夹路径作为 IIS 路径。在我的例子中，我正在同步的网站名为 sayedupdemo，所以我想要同步的 IIS 路径是“sayedupdemo/files-to-pub”。现在给我们。
msdeploy.exe –verb:sync -source:contentPath="C:\temp\files-to-pub" -dest:contentPath='sayedupdemo/files-to-pub'
对于 dest 值，我们没有给出任何参数来指示这些命令应该发送到哪个服务器。我们需要添加这些参数。一般需要传入的参数有。
- ComputerName – 这是处理发布操作的 URL 或计算机名称
- 用户名——用户名
- 密码——密码
- AuthType – 要使用的 authType。 NTLM 或基本。对于 WMSvc，这通常是 Basic，对于 Remote Agent Service，这通常是 NTLM
就我而言，我将发布到Windows Azure Web Site。所以我将使用的值是：
所有这些值都可以在 .publishSettings 文件中找到（可以从 WindowsAzure.com 的网站仪表板下载）。对于 ComputerName 值，您需要附加站点名称以获取完整 URL。在上面的示例中，我手动添加了?site=sayedupdemo，这与 Azure 门户中显示的名称相同。所以现在我们的命令是。
msdeploy.exe
–verb:sync
-source:contentPath="C:\temp\files-to-pub"
-dest:contentPath='sayedupdemo/files-to-pub'
,ComputerName="https://waws-prod-blu-001.publish.azurewebsites.windows.net/msdeploy.axd?site=sayedupdemo"
,UserName='$sayedupdemo'
,Password='thisIsNotMyRealPassword'
,AuthType='Basic'
好的，我们快到了！就我而言，我想确保在此过程中不会从服务器中删除任何文件。所以我还要加–enableRule:DoNotDeleteRule。所以我们的命令是现在。
msdeploy.exe
–verb:sync
-source:contentPath="C:\temp\files-to-pub"
-dest:contentPath='sayedupdemo/files-to-pub'
,ComputerName="https://waws-prod-blu-001.publish.azurewebsites.windows.net/msdeploy.axd?site=sayedupdemo"
,UserName='$sayedupdemo'
,Password='thisIsNotMyRealPassword'
,AuthType='Basic'
-enableRule:DoNotDeleteRule
在执行此命令之前，我将首先通过–whatif 执行它。这将给我一个总结，哪些操作将不会实际引起任何变化。当我这样做时，结果如下图所示。
在我验证这些更改都是故意的后，我删除了–whatif 并执行了命令。之后，本地文件被发布到远程服务器。现在我已经同步了每次发布的文件，这将导致只发布更改的文件。
如果您想了解如何同步单个文件，您可以查看我之前的博客文章如何在发布期间使您的网络应用脱机。
目标：自动
在您的情况下，我注意到您使用的是dest:auto，您可以使用它，但您必须将 IIS 应用程序名称作为参数传递，它将替换文件夹的路径。下面是命令。
msdeploy.exe
-verb:sync
-source:contentPath="C:\temp\files-to-pub"
-dest:auto
,ComputerName="https://waws-prod-blu-001.publish.azurewebsites.windows.net/msdeploy.axd?site=sayedupdemo"
,UserName='$sayedupdemo'
,Password='thisIsNotMyRealPassword'
,AuthType='Basic'
-enableRule:DoNotDeleteRule
-setParam:value='sayedupdemo',kind=ProviderPath,scope=contentPath,match='^C:\\temp\\files-to-pub$'