使用mongolite R包将json对象插入MongoDB答案

【问题标题】：Inserting json object into MongoDB using mongolite R package使用mongolite R包将json对象插入MongoDB
【发布时间】：2016-06-29 00:43:00
【问题描述】：

在 R 中有很多用于处理 MongoDB 的包。我开始使用“mongolite”包，因为我使用“jsonlite”和“mongolite”构建在“jsonlite”之上。但是，我有点疑惑，为什么'mongolite'中的insert函数不允许插入json对象（帮助说它插入数据帧）？

我应该使用什么包来存储 json 对象并进行简单的查询？

【问题讨论】：

标签： json r mongodb mongolite

【解决方案1】：

mongolite开发版现在支持直接插入嵌套列表或者json，见https://github.com/jeroenooms/mongolite/issues/42

您还可以使用m$iterate() 或m$iterate()$batch() 查询和取回嵌套列表。

【讨论】：

感谢您的提醒；将开始玩开发版

【解决方案2】：

如果您使用jsonlite，您仍然可以使用mongolite 插入数据，但只有在它也可以被强制转换为data.frame（使用fromJSON）。例如：

js <- '[
  {
    "id": 1,
    "val": "a"
  },
  {
    "id": 2,
    "val": "b"
  },
  {
    "id": 3,
    "val": "c"
  }
] '


library(jsonlite)
library(mongolite)

mongo <- mongo(collection = "test", db = "test", url = "mongodb://localhost",
      verbose = TRUE)

mongo$insert(fromJSON(js))
# Complete! Processed total of 3 rows.
# [1] TRUE

但是，我的理解是 mongolite 包将仅插入 data.frames。例如，采用更复杂的JSON 结构，您会看到我们无法使用mongolite 插入它

js <- '{"foo":[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}],"bar":[[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}]]}'

## if we try to insert this using mongolite we get an error
## because it is not a data.frame
> mongo$insert(fromJSON(js))
Error: is.data.frame(data) is not TRUE

要插入更复杂的JSON 结构，我们可以使用rmongodb 包中的mongo.bson.from.json 函数

library(rmongodb)
mongo <- mongo.create()
mongo.is.connected(mongo)
# [1] TRUE

db <- "test"
coll <- "test"

bs <- mongo.bson.from.JSON(js)

mongo.insert(mongo, ns = paste0(db ,".", coll), b = bs)
# [1] TRUE

注意mongodb实际上存储了BSON：

MongoDB 在后台以称为 BSON 的二进制编码格式表示 JSON 文档。 BSON 扩展了 JSON 模型以提供额外的数据类型并在不同语言中高效地进行编码和解码

参考：JSON and BSON

【讨论】：

不幸的是，rmongodb 在 CRAN 上不再可用。但是无论如何将如何加载您的示例列表？作为两个文件“foo”和“bar”，还是作为一个大文件？在后一种情况下，在命令行上使用mongoimport 就可以了。
@paulwasit rmongodb 对于这种类型的插入非常有用。很遗憾它没有得到支持 - 希望有人会接管它。或者，也许应该将功能请求提交给mongolite，以便它可以插入更复杂的结构。