【问题标题】:How do I log an R session to a file?如何将 R 会话记录到文件中?
【发布时间】:2012-03-27 01:22:33
【问题描述】:

除了通过重定向捕获整个会话之外,还有其他方法可以在 R 会话期间启动和停止记录吗?澄清一下,我正在寻找类似于 Stata 中的 log using 命令的东西。

【问题讨论】:

  • 我也认为这是有史以来最愚蠢的问题,但没有“dumb-question”标签。

标签: r logging stata


【解决方案1】:

还有一个名为logr 的包,它允许您对记录的内容和时间进行大量控制,但比sink() 更易于使用。这是一个例子:

library(logr)

# Open the log
log_open("mytest.log")

# Print text to the log
log_print("Here is a test log statement")

# Print a dataframe to the log
log_print(mtcars)

# Close the log
log_close()


这是生成的日志:

========================================================================= 
Log Path: ./log/mytest.log 
Working Directory: C:/packages/Testing/VS 
User Name: User 
R Version: 4.0.3 (2020-10-10) 
Machine: BOSAK-HOME x86-64 
Operating System: Windows 10 x64 build 18363 
Log Start Time: 2021-01-24 21:13:55 
========================================================================= 

Here is a test log statement 

NOTE: Log Print Time:  2021-01-24 21:13:56 
NOTE: Elapsed Time in seconds: 1.07599902153015 

                     mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Mazda RX4           21.0   6 160.0 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
Mazda RX4 Wag       21.0   6 160.0 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
Datsun 710          22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
Hornet 4 Drive      21.4   6 258.0 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
Hornet Sportabout   18.7   8 360.0 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
Valiant             18.1   6 225.0 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1
Duster 360          14.3   8 360.0 245 3.21 3.570 15.84  0  0    3    4
Merc 240D           24.4   4 146.7  62 3.69 3.190 20.00  1  0    4    2
Merc 230            22.8   4 140.8  95 3.92 3.150 22.90  1  0    4    2
Merc 280            19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
Merc 280C           17.8   6 167.6 123 3.92 3.440 18.90  1  0    4    4
Merc 450SE          16.4   8 275.8 180 3.07 4.070 17.40  0  0    3    3
Merc 450SL          17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
Merc 450SLC         15.2   8 275.8 180 3.07 3.780 18.00  0  0    3    3
Cadillac Fleetwood  10.4   8 472.0 205 2.93 5.250 17.98  0  0    3    4
Lincoln Continental 10.4   8 460.0 215 3.00 5.424 17.82  0  0    3    4
Chrysler Imperial   14.7   8 440.0 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
Fiat 128            32.4   4  78.7  66 4.08 2.200 19.47  1  1    4    1
Honda Civic         30.4   4  75.7  52 4.93 1.615 18.52  1  1    4    2
Toyota Corolla      33.9   4  71.1  65 4.22 1.835 19.90  1  1    4    1
Toyota Corona       21.5   4 120.1  97 3.70 2.465 20.01  1  0    3    1
Dodge Challenger    15.5   8 318.0 150 2.76 3.520 16.87  0  0    3    2
AMC Javelin         15.2   8 304.0 150 3.15 3.435 17.30  0  0    3    2
Camaro Z28          13.3   8 350.0 245 3.73 3.840 15.41  0  0    3    4
Pontiac Firebird    19.2   8 400.0 175 3.08 3.845 17.05  0  0    3    2
Fiat X1-9           27.3   4  79.0  66 4.08 1.935 18.90  1  1    4    1
Porsche 914-2       26.0   4 120.3  91 4.43 2.140 16.70  0  1    5    2
Lotus Europa        30.4   4  95.1 113 3.77 1.513 16.90  1  1    5    2
Ford Pantera L      15.8   8 351.0 264 4.22 3.170 14.50  0  1    5    4
Ferrari Dino        19.7   6 145.0 175 3.62 2.770 15.50  0  1    5    6
Maserati Bora       15.0   8 301.0 335 3.54 3.570 14.60  0  1    5    8
Volvo 142E          21.4   4 121.0 109 4.11 2.780 18.60  1  1    4    2

NOTE: Data frame has 32 rows and 11 columns. 

NOTE: Log Print Time:  2021-01-24 21:13:57 
NOTE: Elapsed Time in seconds: 0.795979976654053 

========================================================================= 
Log End Time: 2021-01-24 21:14:06 
Log Elapsed Time: 0 00:00:10 
========================================================================= 

【讨论】:

  • 注意到距离最初的问题 (!!) 已经 8 年了,我最近确实了解了 logr,但从未见过它的实际应用。我最近很喜欢spdlog,因为我在 C++ 和 Python 中都吐出了信息。感谢您的更新!
【解决方案2】:

为了使用 sink 完成答案

# copy the log to a text file
sink("./logofcode.txt")
Your R code(s) goes here
you can use a stored R code as well using source()
source("./XS_SPEC_CF.R",echo=T, max.deparse.length=1e3)
sink()

【讨论】:

  • 由于我需要经常这样做,所以我将usct01的方法转换为一个小函数:source_with_log <- function(r_script, log_file) { sink(file = log_file) source(r_script, echo = TRUE) sink() }
【解决方案3】:

除了sink 函数之外,您还可以查看txtStartTeachingDemos 包中的相关函数或R2HTML 包中的类似功能(首先出现)。

【讨论】:

    【解决方案4】:

    savehistory(file) 会将整个历史记录写为纯文本,或者,如果您尝试记录输出,请使用 sink(file, split = TRUE)

    【讨论】:

      【解决方案5】:

      你知道基础 R 中的 sink() 吗?

      CRAN 上还有一些日志记录包:logginglog4r 甚至更多。

      最后,Emacs 用户拥有 ESS 及其转录模式。您可以将会话保存为日志,一般来说,“从文件工作并从文件执行”方法会在您工作时构建(部分,仅命令)日志。

      【讨论】:

      • sink() 正是我正在寻找的,但完全不直观的命名。正如我在评论中所说,我知道这很愚蠢。谢谢!
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