当 SEM 已在数据集中计算时，将 SEM 条添加到 ggline 图中

【问题标题】：adding SEM bars to ggline graph when SEM is already calculated in dataset当 SEM 已在数据集中计算时，将 SEM 条添加到 ggline 图中
【发布时间】：2020-07-13 13:55:41
【问题描述】：

我有一个看起来像这样的数据集

well    time        mm          sem
x       basal       83.96792    8.068338
x       stimulus1   153.17250   8.338465
x       recovery    60.45712    5.97283
x       stimulus2   154.26550   6.533665

以及由此代码制作的图表

    ggline(df, x = 'time', y = 'mm', color = 'well', palette = c("#00AFBB", "#E7B800")) + 
  theme_grey()

我想用我已经计算出的 SEM 数字将 SEM 条添加到四个数据点中的每一个（四个点中的每一个都是持续时间的总和，所以这就是我为每个点创建一个 SEM 的方式）以使图表看起来像这样

有什么想法吗？

【问题讨论】：

标签： r ggplot2 standard-error

【解决方案1】：

你可以写：

ggplot(df, aes(x  = time, y = mm, group = well)+
   geom_point()+
   geom_line()+
   geom_errorbar(aes(ymin = mm-sem, ymax = mm+sem), width = 0.2)

所以，它应该是这样的：

但根据您的数据框和代码，我认为您更需要这样的东西：

ggplot(df, aes(x = factor(time,unique(time)), y =mm, group = well, color = time))+
  geom_point()+
  geom_errorbar(aes(ymin = mm-sem, ymax = mm+sem), width = 0.2)+
  scale_color_manual(values = rep(c("#00AFBB", "#E7B800"),2))

它回答了你的问题吗？

可重现的示例

structure(list(well = c("x", "x", "x", "x"), time = c("basal", 
"stimulus1", "recovery", "stimulus2"), mm = c(83.96792, 153.1725, 
60.45712, 154.2655), sem = c(8.068338, 8.338465, 5.97283, 6.533665
)), row.names = c(NA, -4L), class = c("data.table", "data.frame"
))

【讨论】：