【问题标题】:How to print ggplot for multiple tables in this case?在这种情况下如何为多个表打印 ggplot?
【发布时间】:2021-08-31 15:52:59
【问题描述】:

我有这段代码可以打印多个表格

    library(tidyverse)
    library(dplyr)
    library(purrr)
    
    u<- c("D", "B", "C", "A")
    
    l<- list(`0` = structure(list(X70 = "D", X71 = "C", X72 = "C", X73 = "A", X74 = "B", X75 = "C", X76 = "D", X77 = NA_character_, X78 = "B", X79 = "D", X80 = "C", Q = 1), row.names = 32L, class = "data.frame"), `1` = structure(list(X70 = c("D", "B", "D", "D", "B", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X71 = c("B", "B", "C", "C", "C", NA, "D", "B", "C", "A", "C"), X72 = c("A", "A", "C", "B", "C", "C", "C", "C", "D", "B", NA), X73 = c("B", "C", "C", "B", "C", "D", "A", "B", "C", "C", NA), X74 = c("B", "A", "C", "D", "B", "D", NA, "D", "D", "D", NA), X75 = c("C", "C", "B", "C", "D", "D", "C", "A", "C", "C", "C"), X76 = c("D", "A", "D", "B", "D", "C", "D", "A", "A", "D", "B"), X77 = c("D", "C", "B", "B", "B", "C", "B", "B", "B", "B", "D"), X78 = c("B", "C", "C", "B", "A", "A", "C", "B", "A", "C", NA), X79 = c("C", "C", NA, NA, "D", "A", "A", "A", "D", "A", "D"), X80 = c("B", "A", NA, NA, "B", "C", "B", NA, "B", "C", "A"), Q = c(2, 2, 1, 1, 2, 2, 1, 1, 4, 3, 1)), row.names = c(8L, 10L, 12L, 17L, 25L, 27L, 28L, 33L, 35L, 38L, 45L), class = "data.frame"), `2` = structure(list(X70 = c("D", "D", "D", "B", "D", "C", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X71 = c("A", "B", "C", "C", "A", "A", "C", "B", "C", "C", "D", "B"), X72 = c("D", "C", "D", "A", "A", "C", "D", "C", NA, "D", "C", "B"), X73 = c("B", "D", "D", "C", "B", "D", "D", "D", NA, NA, "C", "A"), X74 = c("D", "C", "B", "D", "C", "B", "C", "C", "B", NA, "C", "D"), X75 = c("B", "C", "C", "C", NA, "C", "B", "C", "C", "C", "B", "C"), X76 = c("A", "D", "D", "D", NA, "D", "D", "A", "D", "D", "D", "D"), X77 = c("B", "B", "D", "B", NA, "B", "D", "B", "B", "B", "B", "B"), X78 = c("C", "D", "C", "B", NA, "D", "C", "C", "B", "D", "C", NA), X79 = c("A", "D", "D", "D", NA, "D", "A", NA, "A", "D", "B", NA), X80 = c(NA, "C", "C", "A", NA, "C", "C", NA, "B", "C", "C", NA), Q = c(2, 3, 3, 1, 3, 1, 2, 2, 1, 2, 2, 1)), row.names = c(4L, 5L, 6L, 11L, 15L, 16L, 21L, 22L, 26L, 37L, 39L, 43L), class = "data.frame"), `3` = structure(list(X70 = c("A", "A", "D", "C", "D", "D", "D", "D", NA, "D", "D", "D"), X71 = c("B", "C", "D", "D", "C", "C", "B", "C", "C", "C", "A", "D"), X72 = c("B", "C", NA, "B", "A", "C", "B", "A", "C", "C", "D", "B"), X73 = c(NA, "C", "C", "A", "D", "C", "A", "A", "D", "B", "D", "B"), X74 = c(NA, "C", "D", "B", "A", "D", NA, "D", "B", "A", "D", "A"), X75 = c(NA, "C", "B", "D", "C", "C", "C", "C", "C", "B", "C", "D"), X76 = c(NA, "D", "A", "B", "A", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X77 = c(NA, "B", "B", "B", "C", "B", "A", "B", NA, "C", "D", "D"), X78 = c(NA, "C", "C", "B", "C", "B", "A", "C", "D", "C", "C", "C"), X79 = c(NA, "D", "D", NA, "B", "D", "A", "D", "A", "D", "D", "A"), X80 = c(NA, "C", "C", NA, "D", "C", "C", "C", "C", "C", "B", "C"), Q = c(2, 2, 2, 2, 4, 2, 4, 4, 4, 3, 3, 2)), row.names = c(2L, 13L, 14L, 18L, 19L, 20L, 29L, 30L, 34L, 36L, 41L, 44L), class = "data.frame"), `4` = structure(list(X70 = c("D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X71 = c("A", NA, "A", "B", "C", "A", "A", "C", "B", "C", "C", "C"), X72 = c("B", "C", "C", "C", NA, "C", "B", "A", "C", "B", NA, "A"), X73 = c(NA, "D", "D", "D", "B", "D", "D", "D", "C", "A", "A", "C"), X74 = c("C", "A", "C", "D", "C", "C", "A", "A", "C", "D", "D", "D"), X75 = c("C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "D", "C", "C"), X76 = c("D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "A", "D", "D", "A"), X77 = c(NA, "B", "D", "B", NA, "B", "B", "B", "C", "D", NA, "C"), X78 = c("C", "C", "C", "C", "A", "A", "C", "A", "C", "C", "C", "C"), X79 = c("D", "D", "A", "D", "D", "A", "D", "D", "A", "D", "C", "C"), X80 = c("C", "C", "C", "C", NA, "C", "C", "C", "C", "C", "C", "A"), Q = c(2, 4, 4, 3, 2, 4, 2, 4, 1, 1, 2, 4)), row.names = c(1L, 3L, 7L, 9L, 23L, 24L, 31L, 40L, 42L, 46L, 47L, 48L), class = "data.frame"))
    
    
    out <- lapply(l, function(dat) 
       asplit(as.data.frame(t(sapply(dat, function(x) 
                proportions(table(factor(unlist(x), levels = u)))))), 1) ) %>%
        transpose %>%
        map(bind_rows, .id = 'grp')

out

我想为每个表使用 ggplot 打印,因为它看起来非常漂亮,并且在每行的末尾还有 A、B、C、D。这是为 one 表打印 ggplot 的示例代码。我想为上面 out 打印的每个表格打印这种类型的表格。

library(tidyverse)

d = structure(c(0.129310344827586, 0.258620689655172, 0.318965517241379, 
        0.293103448275862, 0.12972972972973, 0.210810810810811, 0.345945945945946, 
        0.313513513513514, 0.0845070422535211, 0.154929577464789, 0.338028169014085, 
        0.422535211267606, 0.226415094339623, 0.0943396226415094, 0.367924528301887, 
        0.311320754716981), .Dim = c(4L, 4L), .Dimnames = list(c("A", "B", "C", "D"), c("1", "2", "3", "4")))

d = d %>% 
  data.frame %>%
  rownames_to_column(var = "Groups") %>% 
  pivot_longer(cols = 2:5) %>%
  group_by(Groups) %>% 
  mutate(name = sub("X", "", name) %>% as.numeric(), n = 1:n())

ggplot(data = d) + 
  geom_path(aes(x = name, y = value, group = factor(Groups), color = factor(Groups)), size = 0.7) +
  geom_point(aes(x = name, y = value, color = factor(Groups)), size = 2) +
  geom_text(data = d %>% filter(n == max(n)), aes(x = name, y = value, label = Groups, color = factor(Groups)), nudge_x = 0.2) + 
  labs(x = "Group", y = "P") + 
  theme_bw() +
  theme(legend.position = "none")

有关更多信息,请查看以下内容。这里@akrun 使用 matplot 为每个图绘制了一个图:Find proportion of times each character(A,B,C,D) occurs in each column of a list which has 3 datasets


Andy 的代码在控制台中完美运行!然而,我原本想在一个闪亮的应用程序中运行它,但它给出了这个错误:

`.x` must be a vector, not a `reactiveExpr/reactive/function` object
library(dplyr)
library(tidyr)
library(purrr)
library(ggplot2)

ui<-shinyUI(fluidPage(
  titlePanel(title = h4("proportion graphs", align="center")), sidebarLayout( sidebarPanel( ),
                                                                              
                                                                              mainPanel(
                                                                                # create a uiOutput
                                                                                uiOutput("plots")
                                                                              )
  )
  
))


server<- shinyServer(
  
  function(input, output) {
    #1 Dataset l
    l<- reactive({
      f<- list(`0` = structure(list(X70 = "D", X71 = "C", X72 = "C", X73 = "A", X74 = "B", X75 = "C", X76 = "D", X77 = NA_character_, X78 = "B", X79 = "D", X80 = "C", Q = 1), row.names = 32L, class = "data.frame"), `1` = structure(list(X70 = c("D", "B", "D", "D", "B", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X71 = c("B", "B", "C", "C", "C", NA, "D", "B", "C", "A", "C"), X72 = c("A", "A", "C", "B", "C", "C", "C", "C", "D", "B", NA), X73 = c("B", "C", "C", "B", "C", "D", "A", "B", "C", "C", NA), X74 = c("B", "A", "C", "D", "B", "D", NA, "D", "D", "D", NA), X75 = c("C", "C", "B", "C", "D", "D", "C", "A", "C", "C", "C"), X76 = c("D", "A", "D", "B", "D", "C", "D", "A", "A", "D", "B"), X77 = c("D", "C", "B", "B", "B", "C", "B", "B", "B", "B", "D"), X78 = c("B", "C", "C", "B", "A", "A", "C", "B", "A", "C", NA), X79 = c("C", "C", NA, NA, "D", "A", "A", "A", "D", "A", "D"), X80 = c("B", "A", NA, NA, "B", "C", "B", NA, "B", "C", "A"), Q = c(2, 2, 1, 1, 2, 2, 1, 1, 4, 3, 1)), row.names = c(8L, 10L, 12L, 17L, 25L, 27L, 28L, 33L, 35L, 38L, 45L), class = "data.frame"), `2` = structure(list(X70 = c("D", "D", "D", "B", "D", "C", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X71 = c("A", "B", "C", "C", "A", "A", "C", "B", "C", "C", "D", "B"), X72 = c("D", "C", "D", "A", "A", "C", "D", "C", NA, "D", "C", "B"), X73 = c("B", "D", "D", "C", "B", "D", "D", "D", NA, NA, "C", "A"), X74 = c("D", "C", "B", "D", "C", "B", "C", "C", "B", NA, "C", "D"), X75 = c("B", "C", "C", "C", NA, "C", "B", "C", "C", "C", "B", "C"), X76 = c("A", "D", "D", "D", NA, "D", "D", "A", "D", "D", "D", "D"), X77 = c("B", "B", "D", "B", NA, "B", "D", "B", "B", "B", "B", "B"), X78 = c("C", "D", "C", "B", NA, "D", "C", "C", "B", "D", "C", NA), X79 = c("A", "D", "D", "D", NA, "D", "A", NA, "A", "D", "B", NA), X80 = c(NA, "C", "C", "A", NA, "C", "C", NA, "B", "C", "C", NA), Q = c(2, 3, 3, 1, 3, 1, 2, 2, 1, 2, 2, 1)), row.names = c(4L, 5L, 6L, 11L, 15L, 16L, 21L, 22L, 26L, 37L, 39L, 43L), class = "data.frame"), `3` = structure(list(X70 = c("A", "A", "D", "C", "D", "D", "D", "D", NA, "D", "D", "D"), X71 = c("B", "C", "D", "D", "C", "C", "B", "C", "C", "C", "A", "D"), X72 = c("B", "C", NA, "B", "A", "C", "B", "A", "C", "C", "D", "B"), X73 = c(NA, "C", "C", "A", "D", "C", "A", "A", "D", "B", "D", "B"), X74 = c(NA, "C", "D", "B", "A", "D", NA, "D", "B", "A", "D", "A"), X75 = c(NA, "C", "B", "D", "C", "C", "C", "C", "C", "B", "C", "D"), X76 = c(NA, "D", "A", "B", "A", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X77 = c(NA, "B", "B", "B", "C", "B", "A", "B", NA, "C", "D", "D"), X78 = c(NA, "C", "C", "B", "C", "B", "A", "C", "D", "C", "C", "C"), X79 = c(NA, "D", "D", NA, "B", "D", "A", "D", "A", "D", "D", "A"), X80 = c(NA, "C", "C", NA, "D", "C", "C", "C", "C", "C", "B", "C"), Q = c(2, 2, 2, 2, 4, 2, 4, 4, 4, 3, 3, 2)), row.names = c(2L, 13L, 14L, 18L, 19L, 20L, 29L, 30L, 34L, 36L, 41L, 44L), class = "data.frame"), `4` = structure(list(X70 = c("D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D"), X71 = c("A", NA, "A", "B", "C", "A", "A", "C", "B", "C", "C", "C"), X72 = c("B", "C", "C", "C", NA, "C", "B", "A", "C", "B", NA, "A"), X73 = c(NA, "D", "D", "D", "B", "D", "D", "D", "C", "A", "A", "C"), X74 = c("C", "A", "C", "D", "C", "C", "A", "A", "C", "D", "D", "D"), X75 = c("C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "D", "C", "C"), X76 = c("D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "D", "A", "D", "D", "A"), X77 = c(NA, "B", "D", "B", NA, "B", "B", "B", "C", "D", NA, "C"), X78 = c("C", "C", "C", "C", "A", "A", "C", "A", "C", "C", "C", "C"), X79 = c("D", "D", "A", "D", "D", "A", "D", "D", "A", "D", "C", "C"), X80 = c("C", "C", "C", "C", NA, "C", "C", "C", "C", "C", "C", "A"), Q = c(2, 4, 4, 3, 2, 4, 2, 4, 1, 1, 2, 4)), row.names = c(1L, 3L, 7L, 9L, 23L, 24L, 31L, 40L, 42L, 46L, 47L, 48L), class = "data.frame")) })
    
    
    #2 Vector u
    u <- reactive({
      u <- c("D", "B", "C", "A")
    })
    
    #3 reactive expression to process data
    out <- reactive({
      l <- l()
      u <- u()                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
      
      lapply(l, function(dat) 
        asplit(as.data.frame(t(sapply(dat, function(x) 
          proportions(table(factor(unlist(x), levels = u)))))), 1) ) %>%
        transpose %>%
        map(bind_rows, .id = 'grp')
    })
    
    #4 render plots 
    output$plots <- renderUI({
      
      plots <- function(x){
        d = x %>% 
          as.data.frame() %>%
          tidyr::pivot_longer(!grp) %>%
          dplyr::group_by(name) %>% 
          dplyr::mutate(n = 1:n())
        
        ggplot(data = d) + 
          geom_path(aes(x = grp, y = value, group = factor(name), color = factor(name)), size = 0.7) +
          geom_point(aes(x = grp, y = value, color = factor(name)), size = 2) +
          geom_text(data = d %>% filter(n == max(n)), aes(x = grp, y = value, label = name, color = factor(name)), nudge_x = 0.2) + 
          labs(x = "Group", y = "P", title = "") + 
          theme_bw() +
          theme(legend.position = "none")
      }
      plot_objects <- purrr::map(out, plots)
      
      
    })
    
  } )

shinyApp(ui,server)

【问题讨论】:

    标签: r ggplot2 tidyverse


    【解决方案1】:

    所以,这是使用purrr::map 的好机会。将代码应用到一个数据帧,您已经成功了一半。

    您可以将上面编写的代码放入函数中。

    library(dplyr)
    library(tidyr)
    library(purrr)
    library(ggplot2)
    
    plots <- function(x){
      d = x %>% 
        as.data.frame() %>%
        tidyr::pivot_longer(!grp) %>%
        dplyr::group_by(name) %>% 
        dplyr::mutate(n = 1:n())
    
    ggplot(data = d) + 
      geom_path(aes(x = grp, y = value, group = factor(name), color = factor(name)), size = 0.7) +
      geom_point(aes(x = grp, y = value, color = factor(name)), size = 2) +
      geom_text(data = d %>% filter(n == max(n)), aes(x = grp, y = value, label = name, color = factor(name)), nudge_x = 0.2) + 
      labs(x = "Group", y = "P", title = "") + 
      theme_bw() +
      theme(legend.position = "none")
    }
    

    然后,在您的out 列表中使用purrr::map。这将返回您可以绘制的 ggplot 对象列表。

    plot_objects &lt;- purrr::map(out, plots)

    最后,如果您想将它们全部放在一个页面上,就像在您提供的链接中一样,那么您可以执行以下操作:

    library(ggpubr)
    
      ggpubr::ggarrange(
      plotlist = plot_objects,
      ncol = 3,
      nrow = 4, 
      labels = names(plot_objects), 
      hjust = -5,
      vjust = 2
    )
    

    【讨论】:

    • 这很完美!但是,我最初想在一个闪亮的应用程序中运行它。您知道为什么这在闪亮的应用程序中不起作用吗?我已经在描述中编辑了闪亮的代码。
    • 太棒了!我会尝试查看这篇文章(那里也有一些其他有用的链接):stackoverflow.com/questions/51325956/…
    • @ujjwaltyagi 太棒了!很高兴你让它工作。您应该在问题的底部添加一个更新,说明您是如何解决它的,因为它可以帮助其他人!
    猜你喜欢
    • 2018-04-10
    • 1970-01-01
    • 1970-01-01
    • 1970-01-01
    • 2017-10-28
    • 2013-01-01
    • 1970-01-01
    • 2017-03-01
    • 1970-01-01
    相关资源
    最近更新 更多